[发明专利]一种高光谱成像鉴定微生物的方法

摘要

本发明涉及一种高光谱成像鉴定微生物的方法。该方法包括以下步骤：1)获得已知微生物纯培养样品和待鉴定未知菌的高光谱图像；2)对高光谱图像进行校正处理，得到高光谱校正图像；3)建立高光谱反射率曲线；4)对高光谱反射率曲线进行去噪平滑处理，得到高光谱吸收曲线；5)分析已知微生物的高光谱吸收曲线的特征差异，确定反映该特征差异的种属鉴定波段；6)确定用于菌种鉴定的残差平方和阈值；7)在种属鉴定波段下，计算待鉴定未知菌与已知微生物的高光谱吸收曲线的残差平方和，与阈值比较，完成鉴定。该方法主要是利用微生物纯培养样品的表型及内部特征在特定波段上的特征吸收差异，实现微生物种属关系的鉴定，提高鉴定效率。

主权项

1.一种高光谱成像鉴定微生物的方法，其特征在于，包括以下步骤：1)对参考白板、已知微生物纯培养样品和待鉴定未知菌进行高光谱成像，得到相应样品的高光谱图像；所述参考白板为标准培养基；2)对步骤1)所得高光谱图像进行校正处理，得到高光谱校正图像；3)提取高光谱校正图像的光谱反射率信息，建立已知微生物和待鉴定未知菌的高光谱反射率曲线；4)对高光谱反射率曲线进行去噪平滑处理，得到高光谱吸收曲线；5)分析已知微生物的高光谱吸收曲线的特征差异，确定反映该特征差异的种属鉴定波段；6)对某已知微生物的多个平行处理样品的相应高光谱吸收曲线进行归一化处理，得到归一化曲线；在种属鉴定波段下，计算该已知微生物的各平行处理样品的高光谱吸收曲线与归一化曲线的残差平方和，确定用于菌种鉴定的残差平方和阈值；7)在种属鉴定波段下，计算待鉴定未知菌的高光谱吸收曲线与已知微生物的归一化曲线的残差平方和，根据步骤6)确定的残差平方和阈值判定待鉴定未知菌的种属关系，完成鉴定。