[发明专利]一种适用于PacBio测序平台的扩增子混样测序文库构建方法在审

专利信息
申请号: 201811067161.7 申请日: 2018-09-13
公开(公告)号: CN109056077A 公开(公告)日: 2018-12-21
发明(设计)人: 方涛 申请(专利权)人: 武汉菲沙基因信息有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06
代理公司: 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 代理人: 冯子玲
地址: 430000 湖北省武汉市东湖高新技术开发区高新*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明涉及一种适用于PacBio测序平台的扩增子混样测序文库构建方法,针对现有PacBio核酸测序平台应用于扩增子扩增的文库构建中,存在试剂成本高、步骤复杂等技术问题,该方法基于扩增子样本的扩增原理,结合PacBio测序技术特征,针对每个待测样本在第一步扩增中引入反向互补的标签序列,使同一次扩增的扩增子都标记有标签序列,将带有不同标签的扩增子混合,标签序列在后续文库构建中一直保留,因此该方法可实现多个扩增子样品仅需一次文库构建,简化了实验操作流程,提高了建库效率,降低了测序成本。本发明在设计标签序列时,使每种样本的两个引物5’端添加的标签序列反向互补,测序时两端均可识别出标签序列,极大提高扩增子样本的标签序列识别效率。
搜索关键词: 扩增子 标签序列 扩增 文库构建 样本 测序平台 测序文库 反向互补 测序 构建 混样 测序技术 待测样本 核酸测序 平台应用 实验操作 试剂成本 出标签 可识别 建库 引物 标签 引入 保留
【主权项】:
1.一种适用于PacBio测序平台的扩增子混样测序文库构建方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)设计与合成带标签的扩增引物:每个待测样本设计并合成一对扩增子的扩增引物,其中每对引物的5’端带有标签序列,每对引物的5’端标签序列反向互补且唯一无重复;每对引物的3’端为扩增子的特异性引物;(2)扩增子样本的扩增:分别以各个样本DNA为模板、以对应的带标签的扩增引物为引物进行PCR扩增,扩增之后纯化PCR产物并确定片段的大小分布;(3)将每个样本的DNA扩增纯化产物等摩尔量混样,混样后总量大于2μg;(4)将混样扩增产物进行末端修复并纯化;(5)对步骤(4)中的纯化产物与平末端接头进行连接反应;(6)对步骤(5)获得的连接产物进行外切酶消化和纯化,得到适用于PacBio测序平台的扩增子混样测序文库。
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