[发明专利]一种基于BSA基因定位的自动化分析方法在审
| 申请号： | 201811083678.5 | 申请日： | 2018-09-17 |
| 公开（公告）号： | CN109378038A | 公开（公告）日： | 2019-02-22 |
| 发明（设计）人： | 王萌 | 申请（专利权）人： | 上海派森诺生物科技股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B25/00 | 分类号： | G16B25/00;G16B20/00 |
| 代理公司： | 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 | 代理人： | 吕伴 |
| 地址： | 200030 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开的一种基于BSA基因定位的自动化分析方法，具体包括如下步骤：1)原始数据准备步骤；2)准备数据的校验及导入步骤；3)数据处理步骤；4)结果整理步骤。本发明是基于Linux shell语言的BSA基因定位自动化分析方法，可对下机数据全自动分析，提高数据处理效率和服务器使用效率，最终得到与特定性状关联的基因区域，并提供丰富的定位结果展示图表。 | ||
| 搜索关键词： | 自动化分析 基因定位 数据处理步骤 数据处理效率 服务器使用 全自动分析 定位结果 基因区域 结果整理 原始数据 校验 性状 关联 语言 展示 | ||
【主权项】：
1.一种基于BSA基因定位的自动化分析方法，其特征在于，具体包括如下步骤：1)原始数据准备步骤包括fasta格式的参考基因组序列，以及遗传群体各样本的测序原始下机数据；2)准备数据的校验及导入步骤进入Linux环境，检测准备文件是否齐全，后从存储数据的服务器调取参考基因组序列及测序的下机数据；3)数据处理步骤包括对下机数据质控过滤、比对参考基因组、变异检测、SNP‑index计算、候选区域定位及绘图；4)结果整理步骤对得到的结果进行分类整理，包括参考基因组信息、测序数据质量及数据量信息、比对结果统计、SNP‑index统计结果、定位结果图表进行分析。
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