[发明专利]一种构建基因调控网络的方法在审
| 申请号： | 201811104840.7 | 申请日： | 2018-09-21 |
| 公开（公告）号： | CN109215735A | 公开（公告）日： | 2019-01-15 |
| 发明（设计）人： | 唐东明 | 申请（专利权）人： | 西南民族大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B25/00;G16B40/00;G16B5/00 |
| 代理公司： | 成都信博专利代理有限责任公司 51200 | 代理人： | 刘凯 |
| 地址： | 610041 四川*** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种构建基因调控网络的方法，首先将采用最大信息系数来度量基因表达数据的线性与非线性关系，最大限度保留基因表达数据中的相关性信息，弥补一种模型带来的信息损失；采用局部致峰值聚类对基因表达数据进行修剪，找出数据中的噪数据，边缘数据，最大限度的保留网络的局部相关性；以获得的聚类信息作为条件计算条件最大信息系数来更进一步精细化的构建基因调控网络。本发明提出的方法将减少计算的复杂度，并且先验知识更加可靠，构建调控网络的目的性更强。 | ||
| 搜索关键词： | 构建 基因表达数据 基因调控网络 最大信息 非线性关系 边缘数据 聚类信息 条件计算 先验知识 信息损失 复杂度 精细化 保留 度量 聚类 修剪 网络 调控 | ||
【主权项】：
1.一种构建基因调控网络的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：对原始的基因表达数据进行预处理，然后采用最大信息系数计算两个观测序列之间的距离；步骤2：根据获得的两个观测序列之间的距离信息采用密度峰值聚类分析算法进行聚类分析；步骤3：根据聚类结果分析局部结构与条件通路，然后进行调控网络的构建并进行相应的修剪；步骤4：结果展示。
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