[发明专利]一种通过深度学习计算水分子能量的方法在审
申请号: | 201811133773.1 | 申请日: | 2018-09-27 |
公开(公告)号: | CN109346135A | 公开(公告)日: | 2019-02-15 |
发明(设计)人: | 崔洪光;周立川;商祎行;周毅 | 申请(专利权)人: | 大连大学 |
主分类号: | G16C20/20 | 分类号: | G16C20/20 |
代理公司: | 大连智高专利事务所(特殊普通合伙) 21235 | 代理人: | 胡景波 |
地址: | 116622 辽宁省*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | 本发明公开了一种通过深度学习计算水分子能量的方法,属于分子能量计算技术领域,包括S1:构建水分子数据库,所述水分子数据库包含1000个不同构型水分子的空间坐标和与构型对应的能量;S2:随机选取m个构型和对应能量作为训练组,其余1000‑m个构型作为测试组;S3:将训练组和测试组分子空间坐标转化为两个氢氧键键长rO‑H1,rO‑H2、分子键角θ以及三个原子间距离的倒数1/rO‑H1,1/rO‑H2,1/rH1‑H2;S4:提取训练组能量数据作为输出能量矩阵;S5:构建测试组构型参数输入矩阵和输出能量矩阵;S6:采用双神经层计算结构对能量进行学习;本发明减小了训练组和测试组的比值对于训练结果准确性的影响。 | ||
搜索关键词: | 水分子 构型 测试组 训练组 矩阵 输出能量 构建 数据库 计算技术领域 原子间距离 参数输入 分子空间 分子能量 计算结构 空间坐标 能量数据 随机选取 训练结果 坐标转化 分子键 氢氧键 减小 学习 倒数 神经 | ||
【主权项】:
1.一种通过深度学习计算水分子能量的方法,其特征在于,包括如下步骤:S1:构建水分子数据库,所述水分子数据库包含1000个不同构型水分子的空间坐标和与构型对应的能量;S2:随机选取m个构型和对应能量作为训练组,其余1000‑m个构型和对应能量作为测试组;S3:将训练组分子空间坐标转化为两个氢氧键键长、分子键角θ、三个原子间距离的倒数1/rO‑H1,1/rO‑H2,1/rH1‑H2,所述两个氢氧键键长分别为rO‑H1、rO‑H2;并以此六个参数组成训练组的构型参数输入矩阵;S4:提取训练组能量数据作为输出能量矩阵,并与构型参数输入矩阵一一对应,即训练组的构型参数输入矩阵R和输出能量矩阵Ereal分别为:S5:构建测试组构型参数输入矩阵和输出能量矩阵,矩阵行数为1000‑m;即测试组的构型参数输入矩阵R*和输出能量矩阵Ereal*分别为:S6:依据训练组构型参数,采用双神经层计算结构对水分子能量进行学习,经过双神经层计算得到水分子能量矩阵Ecalc:Ecalc=[tf.nn.relu(R×Win+bin)]×Wout+bout;其中tf.nn.relu为线性整流函数,R为训练组的构型参数输入矩阵,Win为第一神经层权重矩阵,bin为第一神经层偏置矩阵,Wout为第二神经层权重矩阵,bout为第二神经层偏置矩阵。
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