[发明专利]基于模糊谱聚类的不确定PPI网络功能模块挖掘方法有效
| 申请号： | 201811149953.9 | 申请日： | 2018-09-29 |
| 公开（公告）号： | CN109545275B | 公开（公告）日： | 2020-11-10 |
| 发明（设计）人： | 毛伊敏;刘银萍;毛丁慧 | 申请（专利权）人： | 江西理工大学 |
| 主分类号： | G16B15/00 | 分类号： | G16B15/00 |
| 代理公司： | 北京鼎承知识产权代理有限公司 11551 | 代理人： | 李伟波;韩德凯 |
| 地址： | 341000 江*** | 国省代码： | 江西;36 |
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| 摘要： | 本公开提供一种基于模糊谱聚类的不确定PPI网络功能模块挖掘方法包括以下步骤：去掉蛋白质相互作用数据中的重复相互作用和自相互作用，利用边聚集系数来测度每一组相互作用，构建不确定蛋白质相互作用网络图；利用流行距离和蛋白质网络的拓扑特性来改进谱聚类算法的相似度度量，进一步采用谱聚类算法完成对蛋白质相互作用数据的预处理；采用DPCS策略选取初始聚类中心，基于初始聚类中心，采用模糊C‑均值算法不断更新聚类中心和隶属度，进而实现蛋白质相互作用功能模块的挖掘；利用期望稠密度融合边聚集系数的边期望稠密度来过滤挖掘出的蛋白质相互作用功能模块；以及输出预测挖掘出的蛋白质相互作用功能模块。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 模糊 谱聚类 不确定 ppi 网络 功能模块 挖掘 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于模糊谱聚类的不确定PPI网络功能模块挖掘方法，其特征在于，包括以下步骤：构建不确定蛋白质相互作用网络图：去掉蛋白质相互作用数据中的重复相互作用和自相互作用，根据蛋白质相互作用网络图中连接每条边的两个节点的公共邻居节点数，以及所述两个节点度的最小值，利用边聚集系数来测度每一组相互作用，从而构建不确定蛋白质相互作用网络图；预处理蛋白质相互作用数据：利用流行距离和蛋白质网络的拓扑特性来改进谱聚类算法的相似度度量，分别计算在所述网络图中的节点之间的相似度，形成相似度矩阵，进而采用谱聚类算法完成对所述蛋白质相互作用数据的预处理；挖掘蛋白质相互作用功能模块：采用DPCS策略选取初始聚类中心，基于所述初始聚类中心，采用模糊C‑均值算法不断更新聚类中心和隶属度，进而实现蛋白质相互作用功能模块的挖掘；过滤所述蛋白质相互作用功能模块：利用期望稠密度融合边聚集系数的边期望稠密度来过滤挖掘出的所述蛋白质相互作用功能模块；以及输出结果：输出预测挖掘出的蛋白质相互作用功能模块。
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