[发明专利]一种动态基因调控网的网络演化分析方法及装置

摘要

本发明提供了一种动态基因调控网的网络演化分析方法及装置，其中的方法对动态基因调控网网络演化的研究分成两个步骤来进行，首先对基因调控网中模体的转换进行了研究，将现有对基因调控网的研究扩展到了动态的领域，能够更好的捕捉到基因调控网的演化模式，其次通过基于隐空间特征的符号判别算法对将来时刻基因调控网快照的连边符号进行了判别，将研究领域扩展到带符号网络。实现了对动态基因调控网的演化分析，改善了预测效果。

主权项

1.一种动态基因调控网的网络演化分析方法，其特征在于，包括：步骤S1：将基因调控网以模体的形式进行表示，统计快照间的模体转换概率，并将相邻两个快照间的模体转换概率用矩阵表示，得到模体转换概率矩阵，模体为由三个节点构成的子图，快照为以预设时间间隔对基因调控网络进行采样，得到的预设时刻的静态结构，模体转换概率矩阵中的元素用以表征模体从一个时刻到下一时刻的变化情况；步骤S2：以包含前T‑1个时刻的模体转换概率矩阵的模体转换概率张量为基础，预测t时刻的模体转换概率矩阵，获得无符号的网络快照，其中，T表示快照的总数量，t表示时刻；步骤S3：对源网络和目标网络的连边分别提取显式特征和隐式特征，其中，源网络为符号已知的网络，目标网络为基因调控网，并基于隐式特征，将无符号的基因调控网的边通过预设非负矩阵三因式分解的方法映射到隐空间中，以连边在隐空间位置的坐标为特征、连边的符号为标签，通过机器学习方法进行样本的训练和预测，获得未来时刻的有符号的网络快照。