[发明专利]生物序列指纹在审

专利信息
申请号: 201811255595.X 申请日: 2018-10-26
公开(公告)号: CN109727645A 公开(公告)日: 2019-05-07
发明(设计)人: I·M·克尔曼;K·布里迪斯;S·马克尔;D·罗杰斯 申请(专利权)人: 达索系统美国公司
主分类号: G16B50/00 分类号: G16B50/00;G16B25/10
代理公司: 永新专利商标代理有限公司 72002 代理人: 李光颖;王英
地址: 美国马*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 根据本发明的一个实施例,生物序列的特征被表示在包括位集合并且还可以包括针对所述特征的计数、字符串或连续值的指纹中。所述指纹能够与机器学习和统计方法一起使用。这对于(但不限于)药物发现过程而言是特别有利的。所述方法准许关于生物序列执行结构活性关系(SAR)和定量结构活性关系(QSAR)研究。
搜索关键词: 生物序列 指纹 定量结构活性关系 结构活性关系 药物发现过程 机器学习 位集合 字符串 准许 统计 研究
【主权项】:
1.一种用于形成表示生物序列的指纹数据结构的计算机实现的方法,所述计算机实现的方法包括:针对要使用在所述指纹数据结构中的多个分量特征中的每个分量特征,关于表示所述生物序列的生物序列数据结构中的所述分量特征的存在或值查询所述生物序列数据结构;并且将分量特征条目添加到对应于针对所述分量特征查询所述生物序列数据结构的结果的所述指纹数据结构;所述指纹数据结构的所述分量特征条目的至少一部分包括位集合的特征位,所述位集合包括所述指纹数据结构的所述分量特征条目的所述至少一部分。
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