[发明专利]对具有已知序列的生物序列进行分析的方法和系统有效
| 申请号： | 201811290409.6 | 申请日： | 2018-10-31 |
| 公开（公告）号： | CN111128305B | 公开（公告）日： | 2023-09-22 |
| 发明（设计）人： | 方东明;陈晓丽;吴晨雨;陈利鹏;刘欢;刘心 | 申请（专利权）人： | 深圳华大生命科学研究院 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 赵天月 |
| 地址： | 518083 广东省深*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提出了一种对具有已知序列的生物序列进行分析的方法。该方法包括：(a)基于所述生物序列，确定所述生物序列的全部Kmer序列，所述生物序列是通过对大片段氨基酸序列或核苷酸序列进行窗口划分获得的；(b)确定所述全部Kmer序列的每一个的频数，并基于所述频数，确定至少一个高频Kmer和至少一个低频Kmer；(c)基于所述至少一个高频Kmer，确定初步重复候选区域，其中，基于所述低频Kmer与相邻高频Kmer之间的距离，确定是否将所述低频Kmer整合至所述初步重复候选区域中。 | ||
| 搜索关键词： | 具有 已知 序列 生物 进行 分析 方法 系统 | ||
【主权项】：
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