[发明专利]基于已知序列确定目标物种中对应序列的方法和系统有效
| 申请号： | 201811291781.9 | 申请日： | 2018-10-31 |
| 公开（公告）号： | CN111128303B | 公开（公告）日： | 2023-09-15 |
| 发明（设计）人： | 方东明;陈晓丽;吴晨雨;刘欢;刘心 | 申请（专利权）人： | 深圳华大生命科学研究院 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B20/00 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人： | 赵天月 |
| 地址： | 518083 广东省深*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明提出了基于已知序列确定目标物种中对应序列的方法和系统。方法包括：基于所述已知序列，确定所述已知序列的全部Kmer序列，以便获得种子序列Kmer序列集合；获取来自于所述目标物种的测序读段，并基于所述测序读段的至少一部分，确定所述测序读段的Kmer序列，以便获得测序读段Kmer序列集合；确定同时存在于所述测序读段Kmer序列集合和所述种子序列Kmer序列集合的Kmer序列作为延伸起始序列；基于重叠原则，利用所述测序读段Kmer序列集合，对所述延伸起始序列进行延伸处理，以便获得所述已知序列在所述目标物种中的对应序列。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 已知 序列 确定 目标 物种 对应 方法 系统 | ||
【主权项】：
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