[发明专利]与小麦抗菲利普孢囊线虫主效QTL紧密连锁的KASP分子标记及其应用在审

专利信息
申请号: 201811319722.8 申请日: 2018-11-07
公开(公告)号: CN109295252A 公开(公告)日: 2019-02-01
发明(设计)人: 李洪杰;崔磊;周阳;张宏军;孙蕾;孙玉;李静婷;邱丹;杨丽;刘宏伟 申请(专利权)人: 中国农业科学院作物科学研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京科龙寰宇知识产权代理有限责任公司 11139 代理人: 孙皓晨;马鑫
地址: 100081 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了三个与小麦抗菲利普孢囊线虫主效QTL紧密连锁的KASP分子标记及其应用。本发明利用iSelect 90K SNP芯片和BSA‑RNA‑seq技术,首次在小麦品种Madsen7D染色体上定位了一个新的抗菲利普孢囊线虫QTL QCre‑ma7D,该QTL具有良好抗性,可有效控制小麦对菲利普孢囊线虫的发生,减轻线虫造成的产量损失。同时本发明还开发了与该QTL紧密连锁的KASP分子标记BS00150072、BS00021745和BS00154302,该分子标记能够有效地应用到分子标记辅助选择育种工作中,克服常规育种方法所需要的抗性评价周期长、准确性差、受环境影响大的缺点;根据分子标记分析技术,可以实现在室内对小麦资源进行大规模分析,选择携带抗性基因的材料进行表型评价,减少表型评价的工作量,提高选择的准确性,为抗线虫育种提供有利的技术手段。
搜索关键词: 菲利普孢囊线虫 分子标记 紧密连锁 表型评价 主效QTL 小麦 育种 分子标记辅助选择 应用 分子标记分析 产量损失 常规育种 环境影响 技术手段 抗性基因 抗性评价 小麦品种 小麦资源 有效控制 抗线虫 有效地 抗性 染色体 线虫 工作量 室内 携带 分析 开发
【主权项】:
1.与小麦抗菲利普孢囊线虫(Heterodera filipjevi)主效QTL紧密连锁的KASP分子标记,其特征在于,所述的QTL命名为QCre‑ma7D,位于小麦7D染色体上标记BS00150072~7D‑165区间内;所述的KASP分子标记包括KASP_BS00150072、KASP_BS00021745和KASP_BS00154302,所述的KASP分子标记分别通过以下特异性引物扩增得到:用于扩增KASP_BS00150072分子标记的特异性引物:正向引物F1:5′‑ggaagctagtgtacaagaatgttct‑3′正向引物F2:5′‑ggaagctagtgtacaagaatgttcc‑3′反向引物R1:5′‑gcatcggtcatctcaacttcttc‑3′用于扩增KASP_BS00021745分子标记的特异性引物:正向引物F3:5′‑agtcaaacctcgcaaacgt‑3′正向引物F4:5′‑agtcaaacctcgcaaacgc‑3′反向引物R2:5′‑catgagcagcaatgccgac‑3′用于扩增KASP_BS00154302分子标记的特异性引物:正向引物F5:5′‑gtagggtttgactatcgccta‑3′正向引物F6:5′‑gtagggtttgactatcgcctg‑3′反向引物R3:5′‑gtcatctttgttcttcaagtagtcg‑3′。
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