[发明专利]牙鲆育性相关的SNP分子标记及其筛选方法和应用有效
申请号: | 201811373070.6 | 申请日: | 2018-11-19 |
公开(公告)号: | CN109385482B | 公开(公告)日: | 2021-11-26 |
发明(设计)人: | 张晓彦;侯吉伦;王桂兴;王玉芬;孙朝徽;都伟 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院北戴河中心实验站 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6811 |
代理公司: | 青岛海昊知识产权事务所有限公司 37201 | 代理人: | 刘艳青 |
地址: | 066100 河北*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | 本发明公开了一种牙鲆育性相关的SNP分子标记及其筛选方法和应用。首先分别选择可育牙鲆和不育DH牙鲆进行cyp21a基因重测序,以初步筛选差异性SNP位点;选择在繁殖季节能正常产卵的可育群体和不能产卵的DH不育群体进行上述SNP位点的大规模验证;利用多重SNaPshot SNP分型方法对牙鲆在步骤(1)得到的SNP位点进行分型;用SPSS软件对分型成功的SNP位点基因型频率进行统计,利用卡方检验进行差异显著性分析,筛选出与牙鲆育性相关的SNP位点。本发明建立了一种牙鲆育性研究模型,提供了一种快速大量建立21OHD动物模型的方法,筛选得到了育性相关的cyp21a基因的SNP位点。 | ||
搜索关键词: | 牙鲆育性 相关 snp 分子 标记 及其 筛选 方法 应用 | ||
【主权项】:
1.一种牙鲆育性相关的SNP分子标记,其特征在于,如下:SNP1‑10,C‑G 位置Extron11‑165,密码子CAG‑GAG,氨基酸谷氨酰胺‑谷氨酸,氨基酸位置487,非同义突变;SNP3‑1,C‑G,位置Extron9‑72,密码子CAG‑CAC,氨基酸谷氨酰胺‑组氨酸,氨基酸位置365,非同义突变;SNP4,C‑T位置Extron8‑90,密码子GTT‑GTC,氨基酸缬氨酸,氨基酸位置333,同义突变;SNP7,C‑T,位置Extron6‑72,密码子TCC‑TCT,氨基酸丝氨酸,氨基酸位置233,同义突变;SNP9,A‑G,位置Extron5‑79,密码子TTG‑CTG,氨基酸亮氨酸,氨基酸位置204,同义突变。
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