[发明专利]基于CRISPR/cas9和APEX2系统识别特异性位点互作RNA的方法在审
| 申请号： | 201811461038.3 | 申请日： | 2018-12-01 |
| 公开（公告）号： | CN109957579A | 公开（公告）日： | 2019-07-02 |
| 发明（设计）人： | 刘贇;邱文青 | 申请（专利权）人： | 复旦大学 |
| 主分类号： | C12N15/85 | 分类号： | C12N15/85;C12N15/90;C12Q1/6806 |
| 代理公司： | 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 | 代理人： | 吴桂琴 |
| 地址： | 200433 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明属于生物技术领域，涉及一种识别特异性位点相互作用RNA的方法。该方法基于CRISPR/cas9和过氧化物酶APEX2系统，其步骤包括：质粒的转化；所述的质粒包括分别表达dcas9蛋白、sgRNA特异性序列或者过氧化物酶APEX2的质粒；使用APEX2进行蛋白的生物素标记；利用链霉素磁珠富集生物素标记蛋白、DNA或者RNA复合物；RNA的提取与纯化；富集RNA的反转录及分析。本方法操作简单、特异性高、重现性好、适应于研究任何给定的染色体位置上的相互作用RNA。 | ||
| 搜索关键词： | 质粒 过氧化物酶 特异性位点 富集 蛋白 生物素标记蛋白 生物技术领域 链霉素磁珠 染色体位置 生物素标记 特异性序列 系统识别 反转录 重现性 转化 分析 研究 | ||
【主权项】：
1.一种识别特异性位点相互作用RNA的方法，其特征在于，该方法基于CRISPR/cas9和过氧化物酶APEX2系统；其步骤包括：1)质粒的转化；所述的质粒包括分别表达dcas9蛋白、sgRNA特异性序列或者过氧化物酶APEX2的质粒；2)使用APEX2进行蛋白的生物素标记；3)利用磁珠富集生物素标记蛋白、DNA或者RNA复合物；4)RNA的提取与纯化；5)富集RNA的反转录及分析。
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