[发明专利]一种西北春小麦性状与标记关联及效应分析的方法

摘要

本发明公开了一种西北春小麦性状与标记关联及效应分析的方法，涉及分子标记领域。包括：选择小麦种子并种植；成熟期测株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数；成熟后收获种子，测定粒宽、粒长、重量，计算千粒重，得到表型数据；利用NSTSYS对农艺性状表型值聚类分析；用CTAB法提取DNA，制备DArT芯片；采用STRUCTURE计算小麦品种群体结构，利用贝叶斯模型划分群体结构，采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析，得到覆盖全基因组的标记数据；将表型数据与覆盖全基因组标记数据进行确定关联位点，获得36个显著相关DArT标记，并明确增效标记与减效标记。本发明的上述DART分子标记可应用于农业育种中。

主权项

1.一种西北春小麦性状与标记关联及效应分析的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：选择小麦种子并种植；成熟期，测量株高、穗长、小穗数、穗粒数、基部不孕小穗数；成熟后，收获种子，采用高通量分子仪测定收获种子的粒宽、粒长、重量，计算千粒重，得到表型数据；利用NSTSYS软件对农艺性状表型值进行聚类分析，并将其分为三大类群；用CTAB法提取DNA，将DNA浓度调至约50‑100ng·μl‑1，制备DArT芯片；采用STRUCTURE计算小麦品种的群体结构，利用贝叶斯模型划分群体结构，采用TASSEL进行群体连锁不平衡分析，得到覆盖全基因组的标记数据，并将其分为7大类群；将所述表型数据与所述覆盖全基因组的标记数据进行确定关联位点，获得36个显著相关DArT标记，分别如下：与株高相关的DArT分子标记的数量为12个，其中，8个为增效标记，分别位于2BS、3AL、3DL、4AL、6BL、7BL染色体上，4个为减效标记，分别位于2BL、6BL、7B染色体上；与穗长相关的DArT分子标记的数量为2个，均为减效标记，分别位于1BL和1DS染色体上；与小穗数相关的DArT分子标记的数量为8个，其中，4个为增效标记，分别位于2BL、4AL和7AS染色体上，4个为减效标记，位于2BL和4BS染色体上；与穗粒数相关的DArT分子标记的数量为3个，其中，1个为增效标记，位于4AS染色体上，2个减效标记位于2BS和3B染色体上；与不实小穗数相关的DArT分子标记的数量为4个，其中，3个为增效标记，位于4AL和2AS染色体上，1个为减效标记，位于4AL染色体上；与粒长相关的DArT分子标记的数量为3个，其中，1个为增效标记，位于3AL染色体上，2个减效标记，位于3DL和6BL染色体上；与千粒重相关的DArT分子标记的数量为1个，其为减效标记，位于4BS染色体上；与粒宽相关的DArT分子标记的数量为4个，其中，1个为增效标记，位于5DL染色体上,3个为减效标记，位于1AL、4BS和6BS染色体上。