[发明专利]一种遗传性妇科肿瘤的基因文库构建方法和试剂盒在审
申请号: | 201811493209.0 | 申请日: | 2018-12-07 |
公开(公告)号: | CN109680038A | 公开(公告)日: | 2019-04-26 |
发明(设计)人: | 曹彦东;周洋;扶媛媛;杨颖 | 申请(专利权)人: | 北京安智因生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6886;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 北京国之大铭知识产权代理事务所(普通合伙) 11565 | 代理人: | 张伟凤 |
地址: | 102600 北京市大*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种遗传性妇科肿瘤的基因文库构建方法和试剂盒,涉及ATM,BARD1,BRCA1,BRCA2,BRIP1,CDH1,CHEK2,NBN,PIK3CA,PALB2,PTEN,RAD51C,RAD51D,STK11,TP53,MSH2,MLH1,MSH6,PMS2,EPCAM共20个基因的突变。目标区域为以上20基因的编码氨基酸的外显子区域及外显子上下游各20碱基区域。为保证目标区域全部覆盖,PCR扩增过程中所必须的引物组被分离为两个独立引物组,分别进行目标区域扩增。而后将PCR产物进行测序标签连接、文库洗脱及再扩增,扩增后纯化,得到测序用文库。该建库方法步骤简单快速,有效降低了文库构建的成本,且涵盖了妇科肿瘤的相关基因。结合高通量测序仪,可快速准确得到相关基因变异,对遗传性妇科肿瘤有重要意义。 | ||
搜索关键词: | 妇科肿瘤 目标区域 遗传性 扩增 基因文库构建 相关基因 试剂盒 引物组 测序 文库 编码氨基酸 高通量测序 外显子区域 标签连接 碱基区域 文库构建 重要意义 基因 外显子 建库 洗脱 突变 涵盖 覆盖 保证 | ||
【主权项】:
1.一种遗传性妇科肿瘤的基因文库构建方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)DNA质量标准:受试者样本的基因组DNA,经过核酸提取、质量检测后,要求基因组DNA符合相应的控制标准;(2)目标区域扩增:利用上述(1)DNA及合成的5’端磷酸化修饰的相应引物组,对目标区域进行PCR扩增;(3)测序标签连接:在DNA连接酶作用下利用上述步骤(2)的PCR产物连接高通量测序平台专用测序标签,测序标签含有区分样本的特异性标签序列;(4)文库纯化:步骤(3)的产物中加入纯化磁珠后混匀纯化;(5)产物洗脱及扩增:在上述步骤(4)中加入PCR扩增预混液,进行PCR扩增反应;(6)扩增产物纯化:在上述步骤(5)的PCR产物中加入磁珠纯化即得文库;(7)文库质检:使用Qubit荧光计对步骤(6)中文库进行定量质检。
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