[发明专利]一种单细胞测序的数据分类方法有效

专利信息
申请号: 201811501781.7 申请日: 2018-12-10
公开(公告)号: CN109658981B 公开(公告)日: 2022-10-04
发明(设计)人: 谢尚潜;刘宇枭;林加论;邢剑锋 申请(专利权)人: 海南大学
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G06K9/62
代理公司: 重庆市信立达专利代理事务所(普通合伙) 50230 代理人: 包晓静
地址: 570228 海*** 国省代码: 海南;46
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摘要: 发明属于生物信息学分析技术领域,公开了一种单细胞测序的数据分类方法;包括有第一条序列(Read1.fastq)的信息识别模块;第二条序列(Read2.fastq)的信息识别模块;条形码列表信息加载(barcodeList)模块;引物信息加载(primerList)模块。本发明主要对单细胞测序技术SPLiT‑seq的数据进行分类,在分类过程中充分考虑条码barcode的信息,这是第一个对单细胞SPLiT‑seq技术的数据分类的方法。在barcode和特征序列中加入了容错比对机制,并使用碱基转换函数,将字符转换成数字进行运算,使单细胞测序数据的分类更加快速和高效。
搜索关键词: 一种 单细胞 数据 分类 方法
【主权项】:
1.一种单细胞测序数据的分类系统,其特征在于,所述单细胞测序的数据分类系统包括:第一条序列阅读模块和第二条序列阅读模块,作为实际测序数据的输入;条形码列表信息模块,用于存放3轮条码序列信息,生成相应的表来加速查询过程;引物信息加载模块,用于存放附件的引文序列信息,生成相应的表来加速查询过程。
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