[发明专利]一种药物预测方法、装置、服务器及存储介质有效
申请号: | 201811516862.4 | 申请日: | 2018-12-12 |
公开(公告)号: | CN109411019B | 公开(公告)日: | 2020-05-05 |
发明(设计)人: | 何松;伯晓晨;文昱琦;刘祯;宋欣雨;杨晓曦 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 |
主分类号: | G16B25/00 | 分类号: | G16B25/00;G16B20/00;G16B40/00 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 王术兰 |
地址: | 100000 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本申请提供了一种药物预测方法,该方法包括:从数据库中获取药物扰动后的基因组表达谱数据,并对基因组表达谱数据进行预处理;将预处理后的基因组表达谱数据转换成药物扰动下的差异表达秩序列;从数据库中获取病原体感染表达谱数据,并对病原体感染表达谱数据进行预处理;根据预处理后的病原体感染表达谱数据构建病原体感染印记基因集;通过基因集富集分析算法将药物扰动下的差异表达秩序列和病原体感染印记基因集进行比对,得到富集分数,并判断富集分数是否为负;若是,则通过富集分数构建病原体和药物的关联网络,获取富集分数靠前的关联关系;对富集分数靠前的关联关系以及病原体和药物的聚类结果进行分析,获得未知病原体的防治药物。 | ||
搜索关键词: | 一种 药物 预测 方法 装置 服务器 存储 介质 | ||
【主权项】:
1.一种药物预测方法,其特征在于,应用于服务器,所述方法包括:从数据库中获取药物扰动后的基因组表达谱数据,并对所述基因组表达谱数据进行预处理;将预处理后的基因组表达谱数据转换成药物扰动下的差异表达秩序列;从数据库中获取病原体感染表达谱数据,并对所述病原体感染表达谱数据进行预处理;根据预处理后的病原体感染表达谱数据构建病原体感染印记基因集;通过基因集富集分析算法将所述药物扰动下的差异表达秩序列和所述病原体感染印记基因集进行比对,得到富集分数,并判断所述富集分数是否为负;若是,则通过所述富集分数构建病原体和药物的关联网络,获取富集分数靠前的关联关系;对所述富集分数靠前的关联关系以及病原体和药物的聚类结果进行分析,获得未知病原体的防治药物。
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