[发明专利]一种面向基因比对算法的加速装置有效
| 申请号： | 201811546046.8 | 申请日： | 2018-12-18 |
| 公开（公告）号： | CN109785905B | 公开（公告）日： | 2021-07-23 |
| 发明（设计）人： | 臧大伟;王元戎;沈华;谭光明;刘伯然;孙凝晖 | 申请（专利权）人： | 中国科学院计算技术研究所 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人： | 王勇 |
| 地址： | 100190 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种面向基因比对算法的加速装置。该加速装置包括主机端和多个加速模块，所述加速模块包括多个存储层、垂直切片管理单元和交换网络，其中：所述主机端用于控制向所述加速模块分发基因测序序列和接收基因比对结果；所述加速模块的存储层用于存储基因参考序列；所述加速模块的垂直切片管理单元用于管理将所述多个存储层进行垂直划分所形成的切片以及执行基因比对算法，获得基因比对结果；所述加速模块的交换网络用于控制该加速模块内部的数据交换以及该加速模块与外部的数据交换。本发明的加速装置利用定制结构能够提高基因比对算法的处理速度。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 面向 基因 算法 加速 装置 | ||
【主权项】：
1.一种面向基因比对算法的加速装置，包括主机端和多个加速模块，所述加速模块包括多个存储层、垂直切片管理单元和交换网络，其中：所述主机端用于控制向所述加速模块分发基因测序序列和接收基因比对结果；所述加速模块的存储层用于存储基因参考序列；所述加速模块的垂直切片管理单元用于管理将所述多个存储层进行垂直划分所形成的切片以及执行基因比对算法，获得基因比对结果；所述加速模块的交换网络用于控制该加速模块内部的数据交换以及该加速模块与外部的数据交换。
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