[发明专利]整合多组学数据推测细胞转分化中关键蛋白质激酶的方法在审
| 申请号： | 201811561138.3 | 申请日： | 2018-12-19 |
| 公开（公告）号： | CN109536473A | 公开（公告）日： | 2019-03-29 |
| 发明（设计）人： | 薛宇;黄鹏羽;林少峰;袁阳阳 | 申请（专利权）人： | 华中科技大学鄂州工业技术研究院;华中科技大学 |
| 主分类号： | C12N9/12 | 分类号： | C12N9/12 |
| 代理公司： | 北京众达德权知识产权代理有限公司 11570 | 代理人： | 刘杰 |
| 地址： | 436044 湖北*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明公开了整合多组学数据推测细胞转分化中关键蛋白质激酶的方法，包括以下步骤：准备整个细胞转分化过程中的细胞样本，将其分成转录组和蛋白质磷酸化组，并分别通过组学检测获得每组相应的原始数据；对原始数据进行预处理，通过转录组筛选表达显著差异的蛋白质激酶，通过蛋白质磷酸化组筛选活性显著差异以及调控显著差异的蛋白质激酶；整合所有存在显著差异的蛋白质激酶，综合衡量，得出关键蛋白质激酶。本发明所述方法能够为细胞转分化的机制研究提供小规模的候选激酶，为细胞转分化机制的研究提供指导方向，极大程度缩小筛选范围，提高研究效率和实验的准确性，变相缩短研发周期，提高实验成功率，降低细胞分化机制研究成本。 | ||
| 搜索关键词： | 显著差异 激酶 蛋白质激酶 关键蛋白质 整合 组学 分化 细胞 蛋白质磷酸化 机制研究 数据推测 原始数据 转录组 筛选 预处理 分化过程 细胞分化 细胞样本 整个细胞 研发 成功率 衡量 研究 调控 检测 | ||
【主权项】：
1.一种整合多组学数据推测细胞转分化中关键蛋白质激酶的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)准备整个细胞转分化过程中的细胞样本，将其分成转录组和蛋白质磷酸化组，并分别通过组学检测获得每组相应的原始数据；(2)对每组组学检测获得的原始数据进行预处理，通过转录组筛选表达显著差异的蛋白质激酶，通过蛋白质磷酸化组筛选活性显著差异的蛋白质激酶以及调控显著差异的蛋白质激酶；(3)整合所有表达、活性、调控均存在显著差异的蛋白质激酶，综合衡量各个蛋白质激酶的差异，得出细胞转分化过程中的关键蛋白质激酶。
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