[发明专利]一种基于微分方程模型的基因调控网络的构建方法在审
| 申请号： | 201811577131.0 | 申请日： | 2018-12-12 |
| 公开（公告）号： | CN109726352A | 公开（公告）日： | 2019-05-07 |
| 发明（设计）人： | 王镇岭 | 申请（专利权）人： | 青岛大学 |
| 主分类号： | G06F17/13 | 分类号： | G06F17/13;G16B5/00 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 266071 *** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明提供一种基于微分方程模型的基因调控网络的构建方法，涉及生物技术和复杂网络科学领域，步骤：在不同时间点对细胞周期以及特定状态条件下的基因表达进行测定，观测各个时间点上或细胞周期中基因表达的变化情况，寻找调控基因和目标基因；获取基因表达的时间序列数据，时间序列数据采用离散化方法，离散成数个表达水平；利用常微分方程的迭代算法，根据建模目的和问题分析做出相应的假设，从大规模基因表达数据中挖掘基因之间的相互作用关系，给出基因调控网络的拓扑结构模型；设定基因调控网络的时间延迟；将基因调控网络图形化展示并进行结构分析；对目标基因调控关系将基因调控网络实验验证。本发明通过数据的初始化处理，减弱了复杂度较高、计算量大的缺点。 | ||
| 搜索关键词： | 基因调控网络 基因表达 时间序列数据 微分方程模型 目标基因 细胞周期 时间点 构建 基因表达数据 拓扑结构模型 常微分方程 初始化处理 图形化展示 表达水平 调控关系 调控基因 迭代算法 复杂网络 结构分析 科学领域 实验验证 问题分析 状态条件 复杂度 计算量 离散化 建模 生物技术 观测 基因 挖掘 | ||
【主权项】：
1.一种基于微分方程模型的基因调控网络的构建方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)在不同时间点对细胞周期以及特定状态条件下的基因表达进行测定，观测各个时间点上或细胞周期中基因表达的变化情况，寻找调控基因和目标基因；(2)获取基因表达的时间序列数据，时间序列数据采用离散化方法，离散成数个表达水平；(3)利用常微分方程的迭代算法，根据建模目的和问题分析做出相应的假设，从大规模基因表达数据中挖掘基因之间的相互作用关系，给出基因调控网络的拓扑结构模型；(4)设定基因调控网络的时间延迟；(5)将基因调控网络图形化展示并进行结构分析；对目标基因调控关系将基因调控网络实验验证。
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