[发明专利]一种基于es倒排索引的化学分子式检索方法在审

专利信息
申请号: 201811584455.7 申请日: 2018-12-24
公开(公告)号: CN109686413A 公开(公告)日: 2019-04-26
发明(设计)人: 杨红飞 申请(专利权)人: 杭州费尔斯通科技有限公司
主分类号: G16C20/90 分类号: G16C20/90;G06F16/31;G06F16/332
代理公司: 杭州求是专利事务所有限公司 33200 代理人: 刘静;邱启旺
地址: 310000 浙江省杭州市*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明公开了一种基于es倒排索引的化学分子式检索方法,本发明结合大数据平台对检索过程进行重新设计,首先通过对es数据库中的分子式进行分词得到的子结构建立倒排索引,并对es数据库中的分子式计算哈希表示;检索时对分子式进行分词得到子结构,并计算哈希表示,利用倒排索引得到子结构匹配的分子式集合,再与得到的分子式集合的哈希表示一一比较,得到输入分子式与分子式集合中每个分子式之间的相似度,按照应用需要输出检索结果。本发明的比较范围为分子式集合,而不是数据库中全部的分子式,减少了比较的次数,进一步加快了分子式的检索。
搜索关键词: 倒排索引 检索 子结构 集合 哈希 化学分子式 数据库 分词 检索过程 检索结果 重新设计 大数据 相似度 匹配 输出 应用
【主权项】:
1.一种基于es倒排索引的化学分子式检索方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1:对es数据库中的分子式建立倒排索引和哈希表示,具体为:1.1对es数据库中的每个分子式进行分词,得到分子式的子结构集合,子结构集合包含2个以上用化学键相连的原子,或单个的除常用原子以外的原子;1.2去掉子结构集合中的相同子结构;1.3把分子式得到的一系列子结构哈希映射到一个由32位整数组成的数组上,得到分子式的哈希表示;分子式得到的一系列子结构作为分子式的索引,建立es数据库中所有分子式的倒排索引。步骤2:检索过程,具体为:2.1检索时对输入的分子式进行分词,得到分子式的子结构集合,计算分子式的哈希表示;2.2用子结构集合在倒排索引中查找匹配项,即查找包含子结构集合中任一子结构的分子式,得到es数据库中匹配的分子式集合T;2.3用输入分子式的哈希表示,与得到的分子式集合T对应的哈希表示一一比较,得到输入分子式与分子式集合T中每个分子式之间的相似度;2.4根据输入分子式与分子式集合T中每个分子式的相似度,按照应用需要,输出T中相似度大于阈值的分子式,或按照相似度从大到小排列,输出前n个最相似的分子式。
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