[发明专利]一种快速导出末端限制性片段长度多态数据的方法

摘要

本发明涉及一种快速导出末端限制性片段长度多态数据的方法，包含有以下几个步骤：第一步、统计分析原始T‑RFLP数据;第二步、数据的导出和保存;第三步、数据的R统计语言进行数据合并和计算。与常规的利用Genemapper软件处理数据相比较，本方法更加快速，可以实现批量处理与导出数据，减少人工挑选图谱的误差。

主权项

1.一种快速导出末端限制性片段长度多态数据的方法，其特征在于包含有以下几个步骤：第一步、统计分析原始T‑RFLP数据第1.1步骤、去除噪音峰图利用标准物的峰高的最高值和最低值选择待测样品范围，将小于标准品最低值的峰高和大于标准品峰高的值去除；第1.2步骤、校正与拟合重叠峰面积(s1)、对重叠峰进行高斯函数校正可取得较好的校正效果,该数学模型为：(s2)、上式简化为：h(t)＝S×Z(σ,τ,t_g,t)；其中，S为峰面积，t_g、σ为高斯峰的中心位置与标准偏差，τ为指数衰减时间常数，t′为积分变量；(s3)、保留时间为t_R1和t_R2的两个单峰发生部分重叠，构成峰顶时间分别为t_P1和t_P2，峰高为H1和H2的复合峰，假设两个峰拟合后面积分别为S1和S2，根据高斯函数得：简化为：从而峰面积可以计算得出：通过归一化校正后的峰面积S拟合得到真实峰面积S′:第二步、数据的导出和保存；第三步、数据的R统计语言进行数据合并和计算。