[发明专利]基于不确定蛋白质相互作用网络中关键蛋白质识别方法在审
| 申请号： | 201811597473.9 | 申请日： | 2018-12-26 |
| 公开（公告）号： | CN109686403A | 公开（公告）日： | 2019-04-26 |
| 发明（设计）人： | 刘维;马良玉;何杰 | 申请（专利权）人： | 扬州大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G06K9/62 |
| 代理公司： | 扬州苏中专利事务所(普通合伙) 32222 | 代理人： | 沈志海 |
| 地址： | 225009 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 基于不确定蛋白质相互作用网络中关键蛋白质识别方法使用SimRank来进行蛋白质相似度计算,通过将不确定网络中计算SimRank问题转换成在确定性网络的SimRank计算，之后，考虑了蛋白质相互作用网络的拓扑特性和蛋白质的生物特征，通过计算边缘聚类系数、基因本体相似度、皮尔逊相关系数、亚细胞定位分数，得出一个重要性分数。最终按分值由大到小排列，输出分值对应的前k个蛋白质即为最后结果。本发明在不确定相互作用网络上，融合生物属性和拓扑特性提高了识别关键蛋白质的准确性，同时使预测结果更加准确，提高了预测的效率,扩展了该技术在生物信息领域的应用范围和实用性。 | ||
| 搜索关键词： | 蛋白质相互作用 关键蛋白质 网络 蛋白质 拓扑特性 相似度计算 亚细胞定位 重要性分数 方法使用 聚类系数 生物属性 生物特征 生物信息 问题转换 预测结果 相似度 确定性 输出 基因 融合 预测 应用 | ||
【主权项】：
1.基于不确定蛋白质相互作用网络中关键蛋白质识别方法，其特征在于,包括如下步骤：(1)输入不确定PPI网络和生物信息；(2)根据不确定PPI网络的链接不确定性，使用SimRank来进行蛋白质相似度计算；(3)根据蛋白质顶点之间的相互作用关系，计算边缘聚类系数；(4)根据蛋白质相似度分数、边缘聚类系数，计算蛋白质拓扑分数；(5)根据蛋白质的生物特性，计算相互作用蛋白质对的基因本体相似度、皮尔逊相关系数、亚细胞定位分数；(6)根据蛋白质拓扑分数、基因本体相似度、皮尔逊相关系数、亚细胞定位分数，计算蛋白质顶点重要性分数；(7)获得每个顶点的重要性分数并由大到小排序，排序后最大的k个值为关键蛋白质。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于扬州大学，未经扬州大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201811597473.9/，转载请声明来源钻瓜专利网。
