[发明专利]一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法有效

专利信息
申请号: 201811597767.1 申请日: 2018-12-25
公开(公告)号: CN109545289B 公开(公告)日: 2020-10-16
发明(设计)人: 史薇;谭皓月;陈钦畅;于红霞 申请(专利权)人: 南京大学
主分类号: G16C20/80 分类号: G16C20/80;G16C20/30;G16C20/20
代理公司: 江苏瑞途律师事务所 32346 代理人: 蒋海军;陈彬
地址: 210023 江苏*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明的一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法,涉及内分泌干扰物的虚拟筛选与活性预测领域。本发明利用子结构频率分析和子结构占比分析提取活性数据化合物的一级警示结构;利用SARpy软件对满足一级警示结构的化合物进行二级警示结构的提取;利用SARpy软件进行三级警示结构的提取;将一级警示结构和二级警示结构组合构成活性预测模块,在预测模块中先筛查出存在特征结构的化合物,再基于二级警示结构筛查出具有潜在内分泌干扰作用的警示化合物;将三级警示结构作为干扰活性预测模块,而后再基于干扰活性预测模块筛查干扰活性。本发明可以对潜在核受体介导的内分泌干扰物进行高通量筛查。
搜索关键词: 一种 基于 分级 警示 结构 通量 内分泌 干扰 方法
【主权项】:
1.一种基于分级警示结构高通量筛查内分泌干扰物的方法,其特征在于,提取一级警示结构:基于PubChem fingerprint分子指纹库,利用子结构频率分析和子结构占比分析提取活性数据化合物的一级警示结构;提取二级警示结构:利用SARpy软件对满足一级警示结构的化合物进行二级警示结构的提取;提取三级警示结构:利用SARpy软件对同时满足一级警示结构和二级警示结构的化合物进行三级警示结构的提取;将一级警示结构和二级警示结构组合构成活性预测模块,在预测模块中先筛查出存在特征结构的化合物,再基于二级警示结构筛查出具有潜在内分泌干扰作用的警示化合物;将三级警示结构作为干扰活性预测模块,而后再基于干扰活性预测模块筛查干扰活性。
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