[发明专利]测序深度的矫正方法及装置在审

专利信息
申请号: 201811614856.2 申请日: 2018-12-27
公开(公告)号: CN109616154A 公开(公告)日: 2019-04-12
发明(设计)人: 张静波;柴景超;伍启熹;王建伟;刘倩;刘珂弟;唐宇 申请(专利权)人: 北京优迅医学检验实验室有限公司
主分类号: G16B20/30 分类号: G16B20/30
代理公司: 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 代理人: 江舟;王晓婷
地址: 100195 北京市海*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种测序深度的矫正方法及装置,其中,上述装置包括:获取模块,用于获取基因组上每个位点的GC含量,以及所述基因组的所有位点的测序深度;划分模块,用于根据每个位点的GC含量将所述所有位点按照指定规则分成N个不同区间,其中,N为正整数;确定模块,用于根据每个区间内位点的测序深度和N个区间的平均测序深度确定所述每个区间内不同测序深度的权重;处理模块,用于针对所述基因组的每个位点,分别将测序深度与每个测序深度对应的权重相乘,得到矫正后的每个位点的测序深度。
搜索关键词: 测序 位点 基因组 矫正 权重 相乘 处理模块 划分模块 获取模块 深度确定 正整数
【主权项】:
1.一种测序深度的矫正装置,其特征在于,包括:获取模块,用于获取基因组上每个位点的GC含量,以及所述基因组的所有位点的测序深度;划分模块,用于根据每个位点的GC含量将所述所有位点按照指定规则分成N个不同区间,其中,N为正整数;确定模块,用于根据每个区间内位点的区间平均深度和N个区间的平均深度确定所述每个区间内不同测序深度的权重;处理模块,用于针对所述基因组的每个位点,分别将测序深度与每个测序深度对应的权重相乘,得到矫正后的每个位点的测序深度。
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