[发明专利]测序深度的矫正方法及装置有效
| 申请号： | 201811616167.5 | 申请日： | 2018-12-27 |
| 公开（公告）号： | CN109767813B | 公开（公告）日： | 2021-06-22 |
| 发明（设计）人： | 柴景超;张静波;伍启熹;王建伟;刘倩;刘珂弟;唐宇 | 申请（专利权）人： | 北京优迅医学检验实验室有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人： | 江舟;王晓婷 |
| 地址： | 100195 北京市海*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： |
本发明提供了一种测序深度的矫正方法及装置，其中，上述装置包括：获取模块，用于获取基因组上每个位点的GC含量，以及基因组的所有位点的测序深度；划分模块，用于根据每个位点的GC含量将所有位点按照指定规则分成N个不同区间，其中，N为正整数；第一处理模块，用于针对每个区间内的每个位点的测序深度D |
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| 搜索关键词： | 深度 矫正 方法 装置 | ||
【主权项】：
1.一种测序深度的矫正装置，其特征在于，包括：获取模块，用于获取基因组上每个位点的GC含量，以及所述基因组的所有位点的测序深度；划分模块，用于根据每个位点的GC含量将所述所有位点按照指定规则分成N个不同区间，其中，N为正整数；第一处理模块，用于针对每个区间内的每个位点的测序深度Dij进行转换处理，得到第一值；确定N个区间的平均测序深度的泊松分布，并对所述泊松分布的值进行与所述测序深度Dij同样的转换处理，得到第二值，其中，i和j均为正整数，Dij代表第i个区间中第j个位点的测序深度；第二处理模块，用于针对所述每个区间，分别确定所述第一值的均值mi1以及所述第二值的均值mi2；根据所述第一值，所述mi1和所述mi2确定第三值；确定模块，用于对所述第三值进行所述转换处理对应的反转换处理，得到矫正后的每个位点的测序深度。
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