[发明专利]仅用于肝癌筛查的特异甲基化检测位点组合的选取方法在审

专利信息
申请号: 201811617790.2 申请日: 2018-12-28
公开(公告)号: CN109686414A 公开(公告)日: 2019-04-26
发明(设计)人: 陈洪亮 申请(专利权)人: 陈洪亮
主分类号: G16H10/40 分类号: G16H10/40;G16H50/50;C12Q1/6886;G06F17/50
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 364000 福建省龙*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开一种仅用于肝癌筛查的特异甲基化检测位点组合的选取方法,本发明通过一系列的筛选步骤寻找处针对单一肝癌的特异甲基化位点,其主要通过设计不同样本类型的对比,校准个体甲基化差异、肝癌I期甲基化差异、不同组织甲基化差异和不同肿瘤间甲基化差异,从而获得一组特异甲基化位点作为诊断标志物来检测肝癌;本方法筛选出来肝癌特异甲基化位点的敏感性能达到92%以上,特异性能达到97%以上,能在诊断过程中表现为只针对肝癌这个癌种进行检测。
搜索关键词: 肝癌 甲基化差异 甲基化位点 甲基化检测 筛查 位点 筛选 诊断标志物 敏感性能 特异性能 样本类型 检测 校准 肿瘤 诊断
【主权项】:
1.仅用于肝癌筛查的特异甲基化检测位点组合的选取方法,其特征在于:该方法包括以下步骤:步骤1:从若干数据库中集中肝癌和其他癌症甲基化数据,其中,集中的数据包括正常人的样本及癌症患者的样本;步骤2:比较肝癌I期患者肝癌组织的甲基化数据与癌旁组织的数据,以及正常人血浆甲基化数据,以筛选处于I期肝癌特异性标志物,从而校准了肝组织特异性甲基化,过滤了血浆(体液)中差异小的甲基化位点;步骤3:比较肝癌I期患者肝癌组织和正常组织甲基化数据,找出肝癌和正常组织甲基化差异位点;步骤4:使用神经网络建模并验证。
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