[发明专利]一种微滴数字PCR仪抗干扰分类方法在审
申请号: | 201811618390.3 | 申请日: | 2018-12-28 |
公开(公告)号: | CN109657731A | 公开(公告)日: | 2019-04-19 |
发明(设计)人: | 李凤玲;范兴江;陈珊;刘源 | 申请(专利权)人: | 长沙理工大学 |
主分类号: | G06K9/62 | 分类号: | G06K9/62;G16B40/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 410004 湖南省*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 本发明公开了一种微滴数字PCR仪抗干扰分类方法,包括:收集PCR仪实验数据,构建二值图像;提取二值图像边缘特征,并计算属性分类区间值,构建分类样本;依据分类样本,用支持向量机分类,优选核函数;以易受干扰的荧光数据区域的中心线初步确定分类阀值,并引入不同分布的适度假阴性人工数据,重新计算阴性微滴荧光强度累计占比确定新分类阀值;重新构建分类样本,反复优化支持向量机;将包含干扰的待测微滴荧光强度数据输入优化支持向量机,输出为每个微滴的类别。本发明的微滴数字PCR仪抗干扰分类方法,能自适应数据形态选取分类阀值,比常用方法分类精度高,有益微滴式数字PCR系统中DNA浓度的绝对定量。 | ||
搜索关键词: | 微滴 分类 数字PCR 分类样本 抗干扰 优化支持向量机 二值图像 构建 支持向量机分类 荧光强度数据 边缘特征 人工数据 实验数据 属性分类 数据形态 荧光数据 重新构建 重新计算 核函数 假阴性 自适应 阴性 荧光 优选 输出 引入 | ||
【主权项】:
1.一种微滴数字PCR仪抗干扰分类方法,其特征在于,包括以下步骤:第一步:收集大量微滴数字PCR过程的荧光强度数据样本,采用图像处理技术将荧光强度数据转化为二值图像;第二步:提取所述二值图像中两个密集区域图像的纵坐标方向荧光强度边缘特征,依据边缘特征图去除异常数据,并初步构建分类样本;第三步:依据所述分类样本,用支持向量机分类,并优选核函数;第四步:在易受干扰的荧光数据区域确定分类阀值:先以易受干扰的荧光数据区域的中心线初步确定分类阀值,再引入多种分布的适度假阴性人工数据,重新计算阴性微滴荧光强度累计占比自适应确定新分类阀值;第五步:依据所述新分类阀值,重新构建分类样本,反复优化分类模型;第六步:将待测微滴荧光强度数据输入所述优化支持向量机分类模型,模型输出为每个微滴的类别。
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