[发明专利]基于PacBio全长转录组测序数据的质控方法有效
| 申请号： | 201811641409.6 | 申请日： | 2018-12-29 |
| 公开（公告）号： | CN109817277B | 公开（公告）日： | 2022-03-18 |
| 发明（设计）人： | 郑洪坤;许国路;杨春鹤;张雪川 | 申请（专利权）人： | 北京百迈客生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君;陈征 |
| 地址： | 101300 北京市顺义区南*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了基于PacBio全长转录组测序数据的质控方法，包括步骤：1)利用IsoSeq分析流程从原始PacBio全长转录组测序数据得到高质量和低质量的一致性全长序列；2)基于Illumina测序数据对低质量一致性全长序列进行校正，过滤仍达不到高质量标准的序列；3)合并高质量和校正后符合条件的低质量一致性全长序列，按照以下标准进行过滤：去除由序列嵌合产生的过长序列；去除自身比对结果中存在回文序列的一致性全长序列；去除能被其他一致性全长序列比对到多个位置的序列。通过多个标准过滤一致性全长序列中可能存在的嵌合序列，降低最终转录组中的假阳性结果比例，提高后续转录组相关分析结果的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 pacbio 全长 转录 序数 方法 | ||
【主权项】：
1.基于PacBio全长转录组测序数据的质控方法，包括步骤：(1)利用IsoSeq分析流程从原始PacBio全长转录组测序数据得到高质量和低质量的一致性全长序列；(2)基于Illumina测序数据对低质量一致性全长序列进行校正，过滤仍达不到高质量标准的序列；(3)合并高质量和校正后符合条件的低质量一致性全长序列，去除由序列嵌合产生的过长序列；(4)去除自身比对结果中存在回文序列的一致性全长序列；(5)去除能被其他一致性全长序列比对到多个位置的嵌合序列。
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