[发明专利]使用磁阻生物传感器阵列表征DNA甲基化在审
| 申请号： | 201880029325.9 | 申请日： | 2018-05-01 |
| 公开（公告）号： | CN110662845A | 公开（公告）日： | 2020-01-07 |
| 发明（设计）人： | 李政録;S·X·王;M·F·汉森;M·杜伏威;G·利兹 | 申请（专利权）人： | 小利兰·斯坦福大学托管委员会;丹麦技术大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6825 | 分类号： | C12Q1/6825;C12Q1/6827 |
| 代理公司： | 31100 上海专利商标事务所有限公司 | 代理人： | 余颖;陈扬扬 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 美国;US |
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| 摘要： | 一种甲基化检测的方法提供了DNA链中甲基化密度的定量描述。亚硫酸氢盐转化[100]含有甲基化和未甲基化位点的DNA链产生具有错配碱基对的转化DNA链。转化DNA链经PCR扩增[102]，并用固定于磁阻(MR)传感器阵列上的互补DNA磁性标记[104]和杂交[106]单链靶DNA链。杂交期间，可以记录结合信号。增加诸如温度或盐浓度之类的严格条件[108]，以使磁性标记的单链靶DNA链从固定于磁阻(MR)传感器阵列上的互补DNA链变性。严格条件增加期间，实时记录产生自变性的磁性标记的单链靶DNA链的变性信号[110]并用于确定甲基化和未甲基化的DNA链的严格条件[112]。DNA链可能还包含野生型基因和突变的基因，因此突变位点可以与甲基化位点同时确定。 | ||
| 搜索关键词： | 磁性标记 严格条件 甲基化 靶DNA 变性 单链 传感器阵列 未甲基化 磁阻 转化 杂交 甲基化检测 甲基化位点 亚硫酸氢盐 野生型基因 互补DNA链 错配碱基 结合信号 实时记录 突变位点 互补DNA 位点 突变 并用 基因 记录 | ||
【主权项】：
1.一种甲基化检测的方法，所述方法提供了DNA链中甲基化密度的定量描述，所述方法包括：/n对含有甲基化和未甲基化位点的DNA链进行亚硫酸氢盐转化，以产生具有错配碱基对的转化DNA链；/n对所述转化DNA链进行PCR扩增，以产生PCR扩增的转化DNA链；/n磁性标记所述PCR扩增的转化DNA链；/n使PCR扩增的转化DNA链与固定于磁阻(MR)传感器阵列上的互补DNA链杂交，其中所述杂交在磁性标记之前或之后进行；/n增加严格条件，以使所述磁性标记的单链靶DNA链由固定于磁阻(MR)传感器阵列上的所述互补DNA链变性；/n增加所述严格条件期间，实时读出产生自变性磁性标记的单链靶DNA链的变性信号；/n由所述变性信号确定甲基化和未甲基化DNA链的严格条件。/n
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