[发明专利]硬叶兜兰基因组SSR分子标记引物组及其开发方法和应用有效
申请号: | 201910049147.2 | 申请日: | 2019-01-18 |
公开(公告)号: | CN109576393B | 公开(公告)日: | 2020-09-29 |
发明(设计)人: | 黄家林;张石宝;胡虹 | 申请(专利权)人: | 中国科学院昆明植物研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6806 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 代芳 |
地址: | 650000 *** | 国省代码: | 云南;53 |
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摘要: | 本发明提供了硬叶兜兰基因组SSR分子标记引物组及其开发方法和应用,属于SSR分子标记技术领域。硬叶兜兰基因组SSR分子标记引物组,包括核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.1~58所示的29对引物。所述29对引物经过试验验证能扩增出清晰稳定条带。经过微卫星开发试验挑选出了240个阳性克隆并进行测序,其中180个(75.0%)克隆含有微卫星序列;根据引物设计的原则,共设计并合成了102对引物。根据PCR扩增及筛选,共有29对引物成功扩增出清晰稳定的条带。本发明提供的引物组能大大丰富硬叶兜兰遗传研究的手段,为将来对硬叶兜兰进行进一步的遗传分析和品种鉴定的研究提供技术基础。 | ||
搜索关键词: | 兜兰 基因组 ssr 分子 标记 引物 及其 开发 方法 应用 | ||
【主权项】:
1.硬叶兜兰基因组SSR分子标记引物组,其特征在于,包括以下29对引物:核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.1所示的H13正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.2所示的H13反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.3所示的H14正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.4所示的H14反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.5所示的H19正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.6所示的H19反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.7所示的H35正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.8所示的H35反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.9所示的H43正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.10所示的H43反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.11所示的H48正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.12所示的H48反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.13所示的H51正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.14所示的H51反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.15所示的H58正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.16所示的H58反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.17所示的H68正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.18所示的H68反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.19所示的H113正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.20所示的H113反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.21所示的H150正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.22所示的H150反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.23所示的H169正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.24所示的H169反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.25所示的H197正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.26所示的H197反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.27所示的H203正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.28所示的H203反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.29所示的H206正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.30所示的H206反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.31所示的H219正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.32所示的H219反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.33所示的H220正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.34所示的H220反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.35所示的H233正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.36所示的H233反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.37所示的H237正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.38所示的H237反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.39所示的H243正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.40所示的H243反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.41所示的H246正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.42所示的H246反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.43所示的H251正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.44所示的H251反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.45所示的H258正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.46所示的H258反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.47所示的H313正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.48所示的H313反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.49所示的H314正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.50所示的H314反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.51所示的H334正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.52所示的H334反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.53所示的H335正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.54所示的H335反向引物;核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.55所示的H343正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.56所示的H343反向引物;和核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.57所示的H371正向引物,核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.58所示的H371反向引物。
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