[发明专利]基因组品种构成的估计方法、装置及电子设备有效
申请号: | 201910064759.9 | 申请日: | 2019-01-23 |
公开(公告)号: | CN109817281B | 公开(公告)日: | 2022-12-23 |
发明(设计)人: | 何俊;吴晓林 | 申请(专利权)人: | 湖南农业大学 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00 |
代理公司: | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人: | 李佳 |
地址: | 410000 *** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 本申请实施例提供一种基因组品种构成的估计方法、装置及电子设备,通过对参考群体中的各参考品种及待估计个体进行基因组测序以得到基因型数据,并根据基因型数据计算得到参考群体中每个SNP的等位基因频率,以及待估计个体的等位基因计数。根据SNP的等位基因频率以及等位基因计数,并构建改进的线性回归模型,以得到根据该改进的线性回归模型所获得的参考群体中的各参考品种对于待估计个体的基因组品种构成。该估计方案基于SNP信息并构建改进的线性回归模型,有效改进线性回归模型的计算准确性,进一步拓展了线性回归模型的应用范围。 | ||
搜索关键词: | 基因组 品种 构成 估计 方法 装置 电子设备 | ||
【主权项】:
1.一种基因组品种构成的估计方法,其特征在于,所述方法包括:确定参考群体信息,并获取待估计个体信息;对所述参考群体中的各参考品种以及所述待估计个体利用基因芯片进行基因组测序以得到基因型数据;根据所述基因型数据计算得到所述参考群体中每个SNP的等位基因频率,以及所述待估计个体的等位基因计数;根据所述SNP的等位基因频率以及所述等位基因计数,并构建改进的线性回归模型,以得到根据所述改进的线性回归模型所获得的所述参考群体中各参考品种对于所述待估计个体的基因组品种构成。
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