[发明专利]一种耳聋相关基因文库的构建方法和应用在审

专利信息
申请号: 201910093256.4 申请日: 2019-01-30
公开(公告)号: CN109763174A 公开(公告)日: 2019-05-17
发明(设计)人: 管敏鑫;蒋萍萍;冀延春;郑静 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06
代理公司: 杭州求是专利事务所有限公司 33200 代理人: 赵杭丽
地址: 310058 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明提供一种耳聋相关基因文库的构建方法,针对耳聋相关致病基因每个编码序列,由5’往3’方向,按序列反向互补原则设计探针序列,在每个探针序列的连接接头,采用寡核苷酸原位合成技术,在芯片上进行寡核苷酸的大规模合成;用氨水将芯片上的寡核苷酸洗脱形成寡核苷酸混合物;通过PCR的方法,采用5’端带有生物素标记的引物,形成带生物素标记的耳聋相关致病基因DNA探针文库。本发明实现了对耳聋相关的已知位点的高通量筛查方法,较单独进行位点筛查和全基因组或者全外显子测序的检测更快速、经济、简便,且对设备及环境要求低,利于推广和应用,适用于耳聋相关人群的筛查和预防性检查。可在检测线粒体DNA的SNP位点中的应用。
搜索关键词: 耳聋 寡核苷酸 筛查 文库 生物素标记 探针序列 相关基因 致病基因 构建 位点 寡核苷酸混合物 芯片 应用 原位合成技术 氨水 大规模合成 外显子测序 预防性检查 线粒体DNA 编码序列 反向互补 环境要求 连接接头 全基因组 对设备 高通量 检测 洗脱 引物 人群
【主权项】:
1.一种耳聋相关基因文库的构建方法,其特征在于,通过以下步骤实现:(1)针对所述基因的编码序列,由5’往3’方向,按照序列反向互补的原则,从第一个碱基开始设计长度为90bp的探针序列,并且每两个相邻的探针序列之间存在重叠,所述每两个相邻的探针序列之间重叠是所述探针长度的1/2或2/3,共计246个基因;(2)在每个探针序列的5’端和3’端,分别添加如SEQ:NO.1和SEQ:NO.2所示序列,形成两端带有接头序列;(3)采用寡核苷酸原位合成技术,在芯片上进行寡核苷酸的大规模合成上述探针序列,将芯片上的寡核苷酸洗脱下来,形成寡核苷酸混合物;(4)通过多重PCR接头连接的方法,采用5’端均带有生物素标记的正向引物TTAGATAGGTGTGTAGGCGC和反向引物TAAGGTGCGTACTAGCTGAC,对寡核苷酸混合物进行扩增,形成带生物素标记的基因DNA探针文库。
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