[发明专利]一种抗凝用药基因检测报告自动化生成方法

摘要

本发明公开了一种抗凝用药基因检测报告自动化生成方法及系统，该方法包括批量获取原始基因测序结果数据，对原始基因测序结果数据进行数据质控处理，根据引物序列从合格基因测序结果数据中确定检测位点，根据各检测位点的碱基及碱基质量值范围判断各检测位点的基因型，从抗凝用药基因检测知识库中读取标准化数据，基于标准化数据、各检测位点的基因型及用户基本信息自动生成抗凝用药基因检测报告；该系统包括测序结果获取模块、测序结果质控模块、基因型判断模块、标准数据获取模块及检测报告生成模块；本发明彻底解决了现有技术存在的时间长、效率低及成本高等问题，避免了对实验人员经验的依赖，具有可信赖度高、适宜推广应用等优点。

主权项

1.一种抗凝用药基因检测报告自动化生成方法，其特征在于：所述方法包括如下步骤；批量获取通过测序仪检测得到的原始基因测序结果数据；对所述原始基因测序结果数据进行数据质控处理，以从所述原始基因测序结果数据中筛选出合格基因测序结果数据；根据引物序列从所述合格基因测序结果数据中确定所有的检测位点，提取出每个检测位点的碱基质量值，并根据各检测位点的碱基及碱基质量值范围判断各检测位点的基因型；从预设的抗凝用药基因检测知识库中读取标准化数据，所述抗凝用药基因检测知识库中存储的标准化数据包括抗凝药物数据及其相应的检测位点和基因型的组合对应的用药指标数据；基于所述标准化数据、各检测位点的基因型及用户基本信息自动生成抗凝用药基因检测报告。