[发明专利]一种基于信息熵的基因序列数字化实现方法及系统在审
| 申请号： | 201910133090.4 | 申请日： | 2019-02-22 |
| 公开（公告）号： | CN109903812A | 公开（公告）日： | 2019-06-18 |
| 发明（设计）人： | 李君一;张丽;平原;李辉年;许清哲;王荣杰;刘博;王亚东 | 申请（专利权）人： | 哈尔滨工业大学(深圳) |
| 主分类号： | G16B25/10 | 分类号： | G16B25/10;G16B40/10 |
| 代理公司： | 深圳市道勤知酷知识产权代理事务所(普通合伙) 44439 | 代理人： | 何兵;饶盛添 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市南*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于信息熵的基因序列数字化实现方法及系统。其中，所述方法包括：输入脱氧核糖核酸DNA序列，设定滑动窗口的长度l及子串长度n，和根据该设定的滑动窗口的长度l，从该输入的脱氧核糖核酸DNA序列的第一个碱基开始，步长为1，和计算该设定的滑动窗口内的给定子串长度下的拓扑熵大小，赋值给该设定的滑动窗口内的碱基，和重复计算该设定的滑动窗口内的给定子串长度下的拓扑熵大小，赋值给该设定的滑动窗口内的碱基，直到到达该输入的脱氧核糖核酸DNA序列的最后一个碱基位置，和输出得到同该输入的脱氧核糖核酸DNA序列长度的数字序列。通过上述方式，能够实现预测基因序列中的外显子区域。 | ||
| 搜索关键词： | 滑动窗口 脱氧核糖核酸DNA 基因序列 碱基 信息熵 拓扑 数字化 外显子区域 碱基位置 数字序列 重复计算 子串 输出 预测 | ||
【主权项】：
1.一种基于信息熵的基因序列数字化实现方法，其特征在于，包括：输入脱氧核糖核酸DNA序列，设定滑动窗口的长度1及子串长度n；根据所述设定的滑动窗口的长度1，从所述输入的脱氧核糖核酸DNA序列的第一个碱基开始，步长为1；计算所述设定的滑动窗口内的给定子串长度下的拓扑熵大小，赋值给所述设定的滑动窗口内的碱基；重复计算所述设定的滑动窗口内的给定子串长度下的拓扑熵大小，赋值给所述设定的滑动窗口内的碱基，直到到达所述输入的脱氧核糖核酸DNA序列的最后一个碱基位置；输出得到同所述输入的脱氧核糖核酸DNA序列长度的数字序列。
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