[发明专利]一种用于对肌层浸润性膀胱癌进行分子分型和/或预后预测的生物标记物组合及其应用在审
| 申请号： | 201910190625.1 | 申请日： | 2019-03-13 |
| 公开（公告）号： | CN109797221A | 公开（公告）日： | 2019-05-24 |
| 发明（设计）人： | 毕德玺;蔚青 | 申请（专利权）人： | 上海市第十人民医院 |
| 主分类号： | C12Q1/6886 | 分类号： | C12Q1/6886;G16B25/10 |
| 代理公司： | 上海申新律师事务所 31272 | 代理人： | 俞涤炯 |
| 地址： | 200000 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种用于对肌层浸润性膀胱癌进行分子分型和/或预后预测的生物标记物组合及其筛选方法和应用，所述生物标记物组合包括以下基因：FGF10、TP53INP1、DDR2、MYC、CDC73、IGF1、PLA2G1B、SKI、FN1、EGFR、PPARG、PDGFRA、PDGFD、GAS6、PDGFC、FNTB和CCNB1。基于该生物标记物组合的转录数据的非负矩阵分解方法聚类分析，可将肌层浸润性膀胱癌分成类，分别对应不同的表达特征谱。该分类分别对应显著不同的总体生存状况，因此可用于生存预后评估。本发明所采用的转录数据分析方法选用生物标记物集合个数少，分析步骤简单，同时满足大样本分析需求，对计算能力要求低，适用于标准化后的转录数据，该转录数据可为转录组学数据亚集、亦可为单独检测的基因转录数据的集合。 | ||
| 搜索关键词： | 生物标记物 转录 浸润性膀胱癌 肌层 分子分型 预后预测 集合 计算能力要求 表达特征谱 单独检测 非负矩阵 分析步骤 基因转录 聚类分析 生存状况 数据分析 预后评估 大样本 转录组 可用 应用 标准化 筛选 分解 基因 分类 分析 | ||
【主权项】：
1.一种用于对肌层浸润性膀胱癌进行分子分型和/或预后预测的生物标记物组合，其特征在于，所述生物标记物组合包括以下基因：FGF10、TP53INP1、DDR2、MYC、CDC73、IGF1、PLA2G1B、SKI、FN1、EGFR、PPARG、PDGFRA、PDGFD、GAS6、PDGFC、FNTB和CCNB1。
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