[发明专利]对测序序列进行变异模拟的方法及其应用在审
申请号: | 201910202272.2 | 申请日: | 2019-03-18 |
公开(公告)号: | CN109920485A | 公开(公告)日: | 2019-06-21 |
发明(设计)人: | 谢张冬;荆瑞琳;杜洋;李大为;玄兆伶;王海良;王娟;肖飞 | 申请(专利权)人: | 浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 322000 浙江省金华市义*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明公开了对测序序列进行变异模拟的方法及其应用,其中,对测序序列进行变异模拟的方法包括:获取待模拟区域的碱基序列;将所述碱基序列进行变异状态标记,以便得到标记后的特征串;选取待添加的变异;将所述待添加的变异整合至所述标记后的特征串上,以便得到添加变异后的特征串;以及将所述添加变异后的特征串进行碱基还原,以便得到变异模拟后的序列。该方法通过对碱基序列的变异状态进行标记,设定碱基的变异类型,从而对各种变异进行模拟,变异模拟的方法简单,生成速度快,并能根据需要设计特殊的变异组合用于测试,变异模拟后的序列的仿真程度高。 | ||
搜索关键词: | 特征串 测序序列 碱基序列 碱基 变异类型 模拟区域 状态标记 整合 还原 应用 测试 | ||
【主权项】:
1.一种对测序序列进行变异模拟的方法,其特征在于,包括:获取待模拟区域的碱基序列;将所述碱基序列进行变异状态标记,以便得到标记后的特征串;选取待添加的变异;将所述待添加的变异整合至所述标记后的特征串上,以便得到添加变异后的特征串;以及将所述添加变异后的特征串进行碱基还原,以便得到变异模拟后的序列。
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