[发明专利]一种fMRI数据空间源相位从实数域到复数域的映射方法有效
申请号: | 201910205693.0 | 申请日: | 2019-03-18 |
公开(公告)号: | CN109948529B | 公开(公告)日: | 2022-02-15 |
发明(设计)人: | 林秋华;张超颖 | 申请(专利权)人: | 大连理工大学 |
主分类号: | G06T11/00 | 分类号: | G06T11/00 |
代理公司: | 大连理工大学专利中心 21200 | 代理人: | 梅洪玉;赵玲玲 |
地址: | 116024 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | 本发明公开了一种fMRI数据空间源相位从实数域到复数域的映射方法,属于生物医学信号处理领域。首先,对fMRI实数域相位数据进行空间ICA分离,根据感兴趣成分的空间参考网络对ICA得到的源成分做极性校正,选取感兴趣成分;接着,选取感兴趣成分的空间源相位,对其做取正值和空间平滑预处理;然后,估计空间源相位值的分布直方图,生成对称化的数据点,并求取拟合这些数据点的函数;最后,将拟合函数的值域变换到[0,π]得到映射函数,并将其用于空间源相位从实数域到复数域的映射。本发明将复数域空间源相位的消噪优势推广到了实数域,克服了传统阈值消噪法的性能劣势,为fMRI数据分析的后处理消噪提供了新的手段。 | ||
搜索关键词: | 一种 fmri 数据 空间 相位 实数 复数 映射 方法 | ||
【主权项】:
1.一种fMRI数据空间源相位从实数域到复数域的映射方法;其特征在于:第一步,对fMRI实数域相位数据进行空间ICA分离,根据感兴趣成分的空间参考网络对ICA得到的源成分做极性校正,选取感兴趣成分;包括如下步骤:(一)输入单被试fMRI实数域相位数据
其中T表示时间点数,V表示脑内体素数;(二)PCA(principle component analysis)降维;对Z进行PCA降维,记模型阶数为N,N≤T,得到降维后数据
(三)ICA成分分离、极性校正与感兴趣成分选取;(1)采用实数域ICA经典算法Infomax对
进行分离得到N个SM成分
(2)利用感兴趣成分的空间参考网络sref对N个SM成分进行极性校正,使正值对应脑激活区:
其中,n=1,…,N,“corr”表示相关系数运算;(3)按照corr(sn,sref)从大到小对sn排序,sn为校正后的SM成分;选取前C个作为感兴趣成分的备选,简记为sc;c=1,…,C;采用“Qiu Y,Lin QH,Kuang LD,Gong XF,Cong FY,Wang YP,Calhoun VD.Spatial source phase:A new feature for identifying spatial differencesbased on complex‑valued resting‑state fMRI data.Human Brain Mapping,1–15,2019”中的方法识别感兴趣成分如下:
其中,“∩”代表交集,“Vox0.5”表示幅值大于0.5的体素数目,最终选出的感兴趣成分表示为sc*;第二步,选取感兴趣成分的空间源相位,对其做取正值和空间平滑预处理;包括如下步骤:(四)best run感兴趣成分空间源相位提取;重复步骤(三)“ICA成分分离、极性校正与感兴趣成分选取”H次,得到H个感兴趣成分sc*,h,h=1,…,H;采用“Kuang LD,Lin QH,Gong XF,Cong F,Sui J,Calhoun VD.Model order effects on ICA of resting‑state complex‑valued fMRI data:application to schizophrenia.Journal of Neuroscience Methods 304,24–38,2018”中的方法,从sc*,h中估计best run,即最好的一次ICA结果,得到感兴趣成分的实数域空间源相位sc*,h*,简记为s;(五)对s取正值,得到s+;(六)空间平滑;对s+采用“Chen Z,Caprihan A,Damaraju E,Rachakonda S,Calhoun VD.Functional brain connectivity in resting‑state fMRI using phase and magnitude data.Journal of Neuroscience Methods 293,299‑309,2018”中的空间平滑策略进行如下平滑,得到![]()
其中,“smooth”表示一个3D空间平滑操作,利用半峰全宽的高斯核;第三步,估计空间源相位值的分布直方图,生成对称化的数据点,并求取拟合这些数据点的函数;包括如下步骤:(七)直方图估计;设
中包含V个体素,即
估计其频率分布直方图
y的每个元素计算如下:
其中,Ui=[ui,ui+1)表示第i个区间,Uwidth=ui+1‑ui表示区间宽度,i=1,..,M,M为区间的个数,![]()
表示顶函数;
表示
中落在Ui区间内的体素,“Num”表示体素数目统计;(八)数据点生成;令xi为区间Ui的右边界点,即xi=ui+1,i=1,..,M,根据直方图生成M个数据点(xi,yi);(九)数据点对称化补充;求取yi的最大值,记其对应的索引为i0;保留i0右侧全部数据点
Δi=1,…,Q,Q为i0右侧数据点总数,Q=M‑i0;以i0为中心,对称产生左侧Q个数据点
组合![]()
和
得到新的2Q+1个数据点,记为
k=i0‑Q,…,i0‑1,i0,i0+1,…,i0+Q;(十)函数拟合;对于数据点
利用非线性最小二乘法进行函数拟合,函数族f选择如下:
其中,β=[β1,β2,β3,β4]为函数f对应的参数向量;求解拟合参数βfit如下:
采用L‑M(Levenberg‑Marquardt)非线性最小二乘法方法求解公式(6),得到参数向量β的更新规则如下:
其中,J为Jacobian矩阵,它的第k行第j列元素为
λ为非负的阻尼因子,公式(6)最终求得的β就是βfit=[βfit,1,βfit,2,βfit,3,βfit,4],拟合函数
求解完毕;第四步,将拟合函数的值域变换到[0,π],得到映射函数,并将其用于空间源相位从实数域到复数域的映射;包括如下步骤:(十一)值域变换;已知拟合函数
的值域为[0,βfit,1],将
的值域变换为[0,π],得到变换后的映射函数
如下:
其中,βmap=[π,βfit,2,βfit,3,βfit,4]为映射函数
的参数向量;(十二)空间源相位映射;将步骤(六)“空间平滑”中得到的
作为
的自变量,
的因变量即为映射后的复数域空间源相位
(十三)输出映射后的复数域空间源相位![]()
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