[发明专利]一种基于基因SNP位点突变的蛋白结构局部三维建模的方法

摘要

本发明公开了一种基于基因SNP位点突变的蛋白结构局部三维建模的方法，包括以下步骤：(1)找到SNP突变位点所在位置；(2)局部建模序列的生长；(3)对每次更新出来的氨基酸序列进行建模，若形成蛋白结构域，则结束“for”循环，执行步骤(4)，否则执行步骤(2)；(4)观察蛋白突变前后结构的变化，并预测功能变化。本发明基于SNP突变位点进行局部建模，可明确其蛋白结构的变化，进而阐明其功能发生的变化，有助于为今后研究该基因突变对疾病发展机制的影响，以及以该基因为作用靶点治疗疾病等奠定基础。

主权项

1.一种基于基因SNP位点突变的蛋白结构局部三维建模的方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)找到SNP突变位点所在位置；(2)局部建模序列的生长：基于Matlab软件编程“for”循环，每次循环突变位点氨基酸左右两侧各增加1个氨基酸之后执行步骤(3)，其中各参数为：i：循环次数；a：突变位点氨基酸；n：氨基酸序列a的长度；n＝a±i；每次循环之后更新原有氨基酸序列，其中，+表示在原有氨基酸序列右侧增加新的氨基酸，‑表示左侧增加新的氨基酸；最后i++,每次循环之后，更新i；(3)对每次更新出来的氨基酸序列进行建模，若形成蛋白结构域，则结束“for”循环，执行步骤(4)，否则执行步骤(2)；(4)观察蛋白突变前后结构的变化，并预测功能变化。