[发明专利]基因序列优化方法、装置及数据处理终端有效
申请号: | 201910286208.7 | 申请日: | 2019-04-10 |
公开(公告)号: | CN109979539B | 公开(公告)日: | 2020-10-02 |
发明(设计)人: | 符红光;钟秀琴;梁晏宾;许阳;黄磊 | 申请(专利权)人: | 电子科技大学 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 杨奇松 |
地址: | 611731 四川省成*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | 本申请实施例提供一种基因序列优化方法、装置及数据处理终端,通过获取待优化的密码子序列对应的氨基酸序列,并将该氨基酸序列导入至预先建立的优化模型进行优化以得到密码子盒序列。其中,该密码子盒序列中包含的每组密码子盒对应至少一组密码子且对应于同一组密码子盒的密码子包含的密码元素相同。再针对各密码子盒,获得该密码子盒对应的密码子,以及该密码子盒对应的氨基酸所对应的密码子,根据两者对应的密码子获得优化的密码子,利用该优化的密码子对待优化的密码子序列进行优化。如此,通过优化得到密码子盒的方式,简化了优化过程的复杂度,并结合氨基酸及密码子盒对应的密码子以得到优化密码子的方式,提高了优化密码子的准确度。 | ||
搜索关键词: | 基因 序列 优化 方法 装置 数据处理 终端 | ||
【主权项】:
1.一种基因序列优化方法,其特征在于,应用于数据处理终端,所述方法包括:获取待优化的密码子序列,得到与所述密码子序列对应的氨基酸序列;将所述氨基酸序列导入至预先建立的优化模型进行优化,输出密码子盒序列,其中,所述密码子盒序列包含多组密码子盒,每组密码子盒对应至少一组密码子且对应于同一组密码子盒的密码子包含的密码元素相同;针对所述密码子盒序列包含的各组密码子盒,根据所述密码子盒对应的密码子,以及所述密码子盒对应的氨基酸所对应的密码子,获得优化的密码子;根据所述优化的密码子对所述待优化的密码子序列进行优化。
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