[发明专利]肺癌突变位点的突变率的检测方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201910291054.0 申请日: 2017-10-24
公开(公告)号: CN110117653A 公开(公告)日: 2019-08-13
发明(设计)人: 张晓妮;刘园园 申请(专利权)人: 深圳海普洛斯医学检验实验室
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858
代理公司: 深圳舍穆专利代理事务所(特殊普通合伙) 44398 代理人: 黄贤炬
地址: 518000 广东省深圳市南山区*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明公开一种肺癌突变位点的突变率的检测方法,其包括:(1)对肺癌患者外周血的血浆样本进行cfDNA的提取,获得cfDNA提取物;(2)针对肺癌相关的EGFR L858R位点设计第一突变型检测探针(序列为SEQ ID NO:5)和第一野生型检测探针(序列为SEQ ID NO:6)、第一引物(序列为SEQ ID NO:1)和第二引物(序列为SEQ ID NO:2),并且针对肺癌相关的EGFR 19号外显子缺失位点设计第二突变型检测探针(序列为SEQ ID NO:7)、第二野生型检测探针(序列为SEQ ID NO:8)、第三引物(序列为SEQ ID NO:3)和第四引物(序列为SEQ ID NO:4);(3)以cfDNA提取物为模板,进行ddPCR检测,获得含有敏感性突变位点的扩增产物;(4)对扩增产物进行数据分析,获得EGFR敏感性突变L858R和19Del的突变率。由此,能够灵敏地获得EGFR敏感性突变L858R和19Del的突变率。
搜索关键词: 突变 肺癌 检测探针 突变位点 扩增产物 位点设计 提取物 突变型 野生型 检测 第二引物 第三引物 第四引物 第一引物 数据分析 血浆样本 试剂盒 外周血 灵敏
【主权项】:
1.一种肺癌突变位点的突变率的检测方法,其特征在于,包括:(1)对肺癌患者外周血的血浆样本进行cfDNA的提取,获得cfDNA提取物;(2)针对肺癌相关的EGFR L858R位点设计第一突变型检测探针和第一野生型检测探针、第一引物和第二引物,并且针对肺癌相关的EGFR 19号外显子缺失位点设计第二突变型检测探针、第二野生型检测探针、第三引物和第四引物;(3)以所述cfDNA提取物为模板,进行ddPCR检测,获得含有敏感性突变位点的扩增产物;(4)对所述扩增产物进行数据分析,获得EGFR敏感性突变L858R和19Del的突变率,其中,所述第一突变型检测探针的序列为SEQ ID NO:5,所述第一野生型检测探针的序列为SEQ ID NO:6,所述第一引物的序列为SEQ ID NO:1,所述第二引物的序列为SEQ ID NO:2,并且所述第二突变型检测探针的序列为SEQ ID NO:7,并且所述第二野生型检测探针的序列为SEQ ID NO:8,所述第三引物的序列为SEQ ID NO:3,所述第四引物的序列为SEQ ID NO:4。
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