[发明专利]一种基于域间残基接触的多域蛋白结构组装方法有效

专利信息
申请号: 201910316906.7 申请日: 2019-04-19
公开(公告)号: CN110164506B 公开(公告)日: 2021-02-26
发明(设计)人: 周晓根;张贵军;彭春祥;胡俊 申请(专利权)人: 浙江工业大学
主分类号: G16B25/10 分类号: G16B25/10;G16B35/20
代理公司: 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 代理人: 王利强
地址: 310014 浙江省*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 一种基于域间残基接触的多域蛋白结构组装方法,从各结构域的三维结构出发,利用结构比对工具对蛋白质库中所有的多域蛋白模板进行打分,并选择得分最高的模板进行组装;然后根据模板生成初始结构,并随机选择一个较小的区域进行刚体旋转和平移,从而生成新的全长结构;其次,根据域间残基接触、模板和域间原子冲突能量来评价组装结构的质量,并根据蒙特卡洛准则接受组装结构;最后,选择所有模板组装得到的结构中能量最低的结构为最终结构。本发明提供一种预测精度较高的基于域间残基接触的多域蛋白结构组装方法。
搜索关键词: 一种 基于 残基 接触 蛋白 结构 组装 方法
【主权项】:
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