[发明专利]一种新型多发性骨髓瘤诺模图构建方法有效

专利信息
申请号: 201910325039.3 申请日: 2019-04-22
公开(公告)号: CN110197701B 公开(公告)日: 2021-08-10
发明(设计)人: 曾志勇;陈君敏 申请(专利权)人: 福建医科大学附属第一医院
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G16B40/00;G16B45/00;G16H50/30
代理公司: 厦门原创专利事务所(普通合伙) 35101 代理人: 徐东峰
地址: 350004 福*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明提供了一种基于十基因特征、血清β2‑微球蛋白和LDH的多发性骨髓瘤诺模图构建方法,包括以下步骤:S1,从GEO数据库中获取MM患者的基因表达谱GSE24080,并对所述基因表达谱GSE24080中的基因进行预处理,获得表达值方差最大的前25%的5413个基因;S2,对所述5413个基因进行WGCNA基因共表达网络分析,以识别共表达的功能模块;S3,通过Pearson相关检验将所述功能模块与临床信息之间的相关性进行评估,以确定最显著的模块;S4,使用Cox比例危险度模型对最显著的模块中的基因进行单变量生存分析,并通过LASSO回归筛选出由10个最佳基因组成的评分模型;S5,建立基于所述评分模型、血清β2M和高LDH的新型诺模图来预测新诊断MM患者的3年OS和5年OS。
搜索关键词: 一种 新型 多发性 骨髓瘤 诺模图 构建 方法
【主权项】:
1.一种基于十基因特征、血清β2‑微球蛋白和LDH的多发性骨髓瘤诺模图构建方法,其特征在于,包括以下步骤:S1,从GEO数据库中获取MM患者的基因表达谱GSE24080,并对所述基因表达谱GSE24080中的基因进行预处理,获得表达值方差最大的前25%的5413个基因;S2,对所述5413个基因进行WGCNA基因共表达网络分析,以识别共表达的功能模块;S3,通过Pearson相关检验将所述功能模块与临床信息之间的相关性进行评估,以确定最显著的模块;S4,使用Cox比例危险度模型对最显著的模块中的基因进行单变量生存分析,并通过LASSO回归筛选出由10个最佳基因组成的评分模型如下:风险评分=0.239*ZNRF3的表达水平+0.219*UBE2T的表达水平+0.164*CCSAP的表达水平+0.161*CENPE的表达水平+0.152*PMS2P5的表达水平+0.147*TMEM97的表达水平+0.131*CDKN2A的表达水平+0.123*SLC39A10的表达水平+0.107*KIF21B的表达水平+0.002*FABP5的表达水平;S5,建立基于所述评分模型、血清β2M和高LDH的新型诺模图来预测新诊断MM患者的3年OS和5年OS。
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