[发明专利]微生物群中物种的关联性挖掘方法在审
| 申请号： | 201910342119.X | 申请日： | 2019-04-26 |
| 公开（公告）号： | CN110136778A | 公开（公告）日： | 2019-08-16 |
| 发明（设计）人： | 宁康;杨朋硕;余少俊;韩毛振 | 申请（专利权）人： | 华中科技大学鄂州工业技术研究院;华中科技大学 |
| 主分类号： | G16B40/00 | 分类号： | G16B40/00 |
| 代理公司： | 杭州宇信知识产权代理事务所(普通合伙) 33231 | 代理人： | 张宇娟 |
| 地址： | 436044 湖北*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种微生物群中物种的关联性挖掘方法，其中所述方法包括：首先，对微生物群落DNA进行高通量测序，计算测序数据得出物种组成和丰度分布；然后，通过Loose Definition方法扩大物种间相关关系候选范围；最后，挖掘间接关系、线性关系和非线性关系。相较于现有技术，本发明能够更好的还原微生物网络，以便于从系统层面研究微生物共出现网络，为发现关键物种间未知的相关关系做铺垫。 | ||
| 搜索关键词： | 微生物群 物种 关联性 挖掘 微生物群落DNA 非线性关系 高通量测序 还原微生物 研究微生物 测序数据 关键物种 间接关系 物种组成 系统层面 线性关系 丰度 铺垫 网络 发现 | ||
【主权项】：
1.一种微生物群中物种的关联性挖掘方法，其特征在于，步骤为：S1采集微生物群DNA样本数据；S2对所述微生物群DNA样本数据进行高通量测序，得到测序数据；S3采用MOthur和Qiime生物信息学工具计算所述测序数据，得出物种组成和丰度分布数据；S4使用Loose Definition法处理物种组成和丰度分布数据；S5构建相关关系网络；S6利用cytoscape软件进行相关关系网络可视化，使用MCODE聚类来检测潜在的聚类，得到物种相关关系网络图；S7分析相关关系网络图，得出微生物群中物种的关联性。
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