[发明专利]一种基于转录组测序开发山茶属植物SSR引物的方法有效
申请号: | 201910416357.0 | 申请日: | 2019-05-16 |
公开(公告)号: | CN111944917B | 公开(公告)日: | 2022-05-13 |
发明(设计)人: | 庄静;王爽 | 申请(专利权)人: | 南京农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11;C12Q1/6806 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 李冉 |
地址: | 210095 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明提供一种基于转录组测序开发山茶属植物引物的方法:以茶树叶片为材料进行cDNA库的构建和illumina测序,经过滤和从头组装后获得转录组数据。使用MISA、SSR Hunter完成位点搜索,并对包含SSR位点的序列进行生物信息学分析。以此为据进行SSR分子标记引物的开发,利用开发的引物对部分山茶属植物材料进行遗传多样性分析。本发明成功设计38对引物,经多态性筛选最终获得16对多态性引物,利用这16对引物检测了部分山茶属植物资源的遗传相似性,验证了这些引物的可用性。本发明为山茶属植物SSR引物开发提供了新思路。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 转录 组测序 开发 山茶 植物 ssr 引物 方法 | ||
【主权项】:
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