[发明专利]一种适用于Iso-Seq的百合鳞茎总RNA提取方法在审

专利信息
申请号: 201910421856.9 申请日: 2019-05-21
公开(公告)号: CN110106167A 公开(公告)日: 2019-08-09
发明(设计)人: 王小斌;吴昀;张琳;李丹青;孙敏译;夏宜平 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10
代理公司: 杭州中成专利事务所有限公司 33212 代理人: 周世骏
地址: 310058 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明涉及分子生物学领域,旨在提供一种适用于Iso‑Seq的百合鳞茎总RNA提取方法,包括:将块状组培鳞茎研磨呈粉末,加入裂解液CLB和β‑巯基乙醇混合液中,裂解至匀浆状态;通过增加样品量和裂解液体积以从总量上提高RNA浓度,并通过加入β‑巯基乙醇结合裂解液以及一系列操作优化裂解过程,有效去除多糖和酚类,使RNA更好地从组织中溶出,再用三倍的基因组清除柱分别去除DNA,最后通过一个吸附柱浓缩RNA,进一步提高RNA浓度。本发明不需使用酚、氯仿等有毒的刺激性试剂,更好保护了操作人员的安全;操作简单,耗时短;提取的RNA完整性好,纯度高,可满足于全长转录组测序等绝大多数分子生物学实验的需要。
搜索关键词: 裂解 总RNA提取 百合鳞茎 巯基乙醇 裂解液 去除 分子生物学领域 分子生物学实验 鳞茎 操作优化 研磨 混合液 基因组 清除柱 吸附柱 样品量 转录组 测序 酚类 氯仿 溶出 匀浆 组培 耗时 浓缩 安全
【主权项】:
1.一种适用于Iso‑Seq的百合鳞茎总RNA提取方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)对实验过程中所用物品及器材进行消毒和灭菌;(2)取块状组培鳞茎的样品,在以液氮维持温度的条件下进行研磨;所得粉末状样品倒入离心管,置于液氮中备用;(3)向新的离心管中依次加入裂解液CLB和β‑巯基乙醇;混匀后加入备用的粉末状样品,裂解至匀浆状态;(4)对裂解物离心处理,取上清加入新的离心管,加入一半体积的无水乙醇;吹打混匀后,立即将混合物加入基因组清除柱;对清除柱离心,弃废液;(5)将基因组清除柱放入新的离心管内,加裂解液RLT PLus后离心处理;收集滤液,并记下体积,加入一半体积的无水乙醇,立即吹打混匀;(6)将混合物加入吸附柱RA中,对吸附柱RA离心,弃废液;(7)向吸附柱RA中加入去蛋白液RW1,室温放置后离心,弃废液;以漂洗液RW对吸附柱RA漂洗两次后,再进行处理后的离心;(8)将吸附柱RA放入RNase free离心管中,加入RNase free water洗脱,得到总RNA溶液。
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