[发明专利]一种用于扩增变异型靶基因片段的非淬灭型寡核苷酸探针及其应用在审

专利信息
申请号: 201910422217.4 申请日: 2019-05-21
公开(公告)号: CN110157703A 公开(公告)日: 2019-08-23
发明(设计)人: 唐东江;赵计昌;黄雅菁;齐盼盼;乔一恺;李雁茭;林上炎 申请(专利权)人: 珠海圣美生物诊断技术有限公司
主分类号: C12N15/11 分类号: C12N15/11;C12N15/10;C12Q1/6806;C12Q1/6886;C40B50/06
代理公司: 北京超成律师事务所 11646 代理人: 王小梅
地址: 519000 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明涉及一种用于扩增变异型靶基因片段的非淬灭型寡核苷酸探针及其应用,所述非淬灭型寡核苷酸满足以下条件:①与野生型靶基因片段完全匹配,与变异型靶基因片段局部错配;②调整寡核苷酸探针长度;③在变异位点附近的特定位置进行修饰(例如锁核酸或肽核酸修饰);④所述探针为非淬灭型寡核苷酸探针,不标记荧光基团和淬灭基团;⑤探针3’末端进行修饰(如双脱氧修饰或氨基修饰,磷酸化修饰);⑥所述变异为单个或者多个碱基变异(如点突变、缺失及其它类型变异);⑦所述探针可单独或者联合使用。本发明所述非淬灭型寡核苷酸探针具有成本低,富集后的检测方式灵活性大以及效果稳定的优点。
搜索关键词: 寡核苷酸探针 淬灭 靶基因 修饰 变异型 探针 扩增 标记荧光基团 磷酸化修饰 氨基修饰 变异位点 淬灭基团 寡核苷酸 碱基变异 效果稳定 点突变 局部错 锁核酸 野生型 肽核酸 脱氧 富集 匹配 应用 检测
【主权项】:
1.一种用于扩增变异型靶基因片段的非淬灭型寡核苷酸探针,其特征在于:(1)所述非淬灭型寡核苷酸探针的核苷酸序列与野生型靶基因片段完全匹配,与变异型靶基因片段在变异位置处发生错配;(2)所述非淬灭型寡核苷酸探针的长度为24~50bp长,其中在变异位置及其两侧1~5bp范围内,至少有1~6个核苷酸经过修饰以增强所述探针与互补链的热稳定性,优选地,所述修饰为锁核酸修饰或者肽核酸修饰;所述非淬灭型寡核苷酸探针的3’末端经过修饰以阻断探针在扩增过程中延伸,优选地,所述修饰为双脱氧修饰、氨基修饰或磷酸化修饰;(3)所述非淬灭型寡核酸探针在退火时可结合野生型靶基因片段和变异型靶基因片段,在延伸时仅结合野生型靶基因片段。
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