[发明专利]一种表征hHRD同源重组缺陷的基因组重组指纹及其鉴定方法在审

专利信息
申请号: 201910462967.4 申请日: 2019-05-30
公开(公告)号: CN110241198A 公开(公告)日: 2019-09-17
发明(设计)人: 刘聪;唐子执;姜长安;张臣良;曾鸣;王小军;李友伟 申请(专利权)人: 成都吉诺迈尔生物科技有限公司;德阳市人民医院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6886;G16B20/50;G16B20/20
代理公司: 重庆乐泰知识产权代理事务所(普通合伙) 50221 代理人: 樊斌
地址: 611730 四川省成都市郫都区*** 国省代码: 四川;51
权利要求书: 暂无信息 说明书: 暂无信息
摘要: 发明涉及一种新型的同源重组缺陷的鉴定方法及其用途。更具体地,本发明涉及利用高通量基因组重测序、生物信息学分析和统计学相关性分析,解析出的hHRD类型同源重组修复缺陷相关的特征性基因组重组指纹。该特征性hHRD重组指纹由于特定同源重组修复机制(即CRL4WDR70‑H2B单泛素化通路)的功能缺陷所导致,包含单样本中基因组重组的总频率,染色体结构变异类型的组成和位点特异性拷贝数变异,用其鉴定带有该特征性突变指纹的传染病或肿瘤,并用于指导PARP抑制剂类的靶向药物治疗,包括但不限于带有此类特征的乳腺癌、卵巢癌、子宫内膜(样)癌、卵巢透明细胞癌、前列腺癌、胰腺癌、皮肤癌和胃癌,以及乙型肝炎病毒感染或者相关的肝纤维化肝硬化、肝癌和胆管细胞癌的方法和用途。
搜索关键词: 同源重组 指纹 基因组重组 特征性 乙型肝炎病毒感染 胰腺癌 染色体结构变异 生物信息学分析 前列腺癌 卵巢 修复 胆管细胞癌 透明细胞癌 位点特异性 皮肤癌 靶向药物 肝纤维化 功能缺陷 子宫内膜 统计学 肝硬化 高通量 基因组 拷贝数 卵巢癌 总频率 乳腺癌 测序 泛素 胃癌 肝癌 解析 突变 传染病 样本 肿瘤 治疗 分析
【主权项】:
1.一种用于鉴定特定机制同源重组修复缺陷(hHRD)的基因组重组指纹,具有如选自图1‑2中至少一图所示的指纹特征。
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