[发明专利]一种单核苷酸多态性的等温分型方法在审
| 申请号： | 201910469857.0 | 申请日： | 2019-05-31 |
| 公开（公告）号： | CN110172500A | 公开（公告）日： | 2019-08-27 |
| 发明（设计）人： | 唐卓;丁盛;陈刚毅;董娟 | 申请（专利权）人： | 中国科学院成都生物研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 610041 *** | 国省代码： | 四川;51 |
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| 摘要： | 本发明属于分子生物学技术领域，提供一种等温条件下单核苷酸多态性(SNP)分型方法。该方法首先根据含SNP位点的目标序列设计相应的环介导等温扩增(LAMP)引物，保证SNP位点能出现在LAMP中间产物的单链环上除内引物互补序列外的大环区域。同时通过SNP所在的单链环区设计可特异性识别野生型和突变型SNP位点的短链寡核苷酸探针，利用不同类型寡核苷酸探针与LAMP中间产物的单链环区杂交稳定性的不同导致的扩增效率的显著差异来实现SNP的高分辨分型。该方法在等温条件下进行，无需精密的变温设备，便捷、准确、分辨率高，分型过程无需开盖操作，可以实现一步分型，适合于现场检测。 | ||
| 搜索关键词： | 分型 单链环 寡核苷酸探针 等温条件 单核苷酸多态性 分子生物学技术 环介导等温扩增 核苷酸多态性 特异性识别 杂交稳定性 互补序列 扩增效率 目标序列 显著差异 现场检测 高分辨 内引物 突变型 野生型 分辨率 变温 大环 短链 开盖 引物 精密 保证 | ||
【主权项】：
1.一种单核苷酸多态性(SNP)等温分型方法，其特征是：根据SNP位点所在区域设计合适的环介导等温扩增反应的引物，使SNP出现在环介导等温扩增中间产物的单链环上，根据单链环序列设计对应的能够特异性识别SNP位点的短链寡核苷酸探针，使其与中间产物的SNP所在区域进行杂交，当其与SNP区域完全互补时，该探针即可使环介导等温扩增反应效率获得巨大的增益效果，若探针与SNP区域不完全互补，则该探针不能稳定的结合至单链环区，因此不能对环介导等温扩增反应有增益效果，由此，通过探针与含SNP位点序列的互补程度的不同导致的扩增效率的显著差异即可实现SNP的准确分型。
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