[发明专利]从肿瘤组织检测ROS1基因融合变异的方法及其试剂盒在审
| 申请号： | 201910494182.5 | 申请日： | 2019-06-09 |
| 公开（公告）号： | CN110229875A | 公开（公告）日： | 2019-09-13 |
| 发明（设计）人： | 卢临萍;班贵宏;祝令香;郭永;杨文军;高娜 | 申请（专利权）人： | 新羿制造科技（北京）有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6851 | 分类号： | C12Q1/6851;C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 102200 北京市昌平*** | 国省代码： | 北京;11 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明提供一种从肿瘤组织检测ROS1基因融合变异的方法及其从肿瘤组织检测ROS1基因融合变异的试剂盒。该方法中ROS1基因上游引物和下游引物分别位于待扩增测靶标区域的两端，所述上游引物、下游引物和/或探针的部分序列跨所述二个相邻外显子拼接区域，使上下游引物之间的待扩增靶标区域至少包括一个所述二个相邻外显子拼接区域；所述ROS1基因的探针和所述参照基因的探针分别用不同的荧光基团进行标记。本发明的方法可以简便快速检测ROS1基因酪氨酸激酶区的高表达，无论是由哪种伴侣融合造成的ROS1融合，均可以进行准确检测，为靶向药物ROS1抑制剂的临床治疗应用提供指导。 | ||
| 搜索关键词： | 基因融合 肿瘤组织 探针 外显子拼接 下游引物 试剂盒 靶标 扩增 基因 检测 基因上游引物 酪氨酸激酶区 临床治疗应用 靶向药物 快速检测 上游引物 荧光基团 准确检测 融合 高表达 抑制剂 引物 伴侣 | ||
【主权项】：
1.一种从肿瘤组织检测ROS1基因融合变异的方法，其特征在于，所述方法包括以下步骤：步骤1：从肿瘤组织获得RNA样本；步骤2：在ROS1基因mRNA断裂位置3’端之后至少二个相邻外显子区域、5’端之前的至少二个相邻外显子区域和参照基因mRNA中分别筛选待测靶标区域；步骤3：对步骤2中筛选的靶标区域分别设计相应的引物对和探针，其中ROS1基因上游引物和下游引物分别位于待扩增测靶标区域的两端，所述上游引物、下游引物和/或探针的部分序列跨所述二个相邻外显子拼接区域，使上下游引物之间的待扩增测靶标区域至少包括一个所述二个相邻外显子拼接区域；所述ROS1基因的探针和所述参照基因的探针分别用不同的荧光基团进行标记；步骤4：对步骤2中所述筛选的待测靶标区域进行微滴式数字PCR扩增；步骤5：根据所述ROS1基因3’端和5’端同所述参照基因的不同荧光染料标记的阳性PCR产物液滴数的比例对ROS1基因3’端和5’端进行归一化，并进一步比较ROS1基因3’端和5’端的比值，来判断肿瘤组织是否存在ROS1基因融合变异。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于新羿制造科技（北京）有限公司，未经新羿制造科技（北京）有限公司许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201910494182.5/，转载请声明来源钻瓜专利网。
